MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3049137390 · doi:10.1093/brain/awaa214

Lack of evidence for genetic association of saposins A, B, C and D with Parkinson’s disease

2020· letter· en· W3049137390 sur OpenAlexafffund
Yuri L. Sosero, Sara Bandrés‐Ciga, Sharon Hassin‐Baer, Roy N. Alcalay, Ziv Gan‐Or

Notice bibliographique

RevueBrain · 2020
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthCanada First Research Excellence FundParkinson CanadaNational Institute on AgingConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementMcGill UniversityParkinson's FoundationBrookdale FoundationFonds de Recherche du Québec - SantéMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésParkinson's diseaseGenetic associationDiseaseGeneticsGenome-wide association studyBiologyLocus (genetics)GeneGenotypeMedicineInternal medicineSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The PSAP gene encodes prosaposin, which is later cleaved into four active saposins: saposin A, B, C and D. Mutations in these enzymes have been linked to specific lysosomal storage disorders. Recently, a genetic association between mutations in saposin D and Parkinson’s disease (PD) has been reported. To further examine whether variants in saposin D or the other saposins could be associated with Parkinson’s disease, we performed Optimized Sequence Kernel Association Test (SKAT-O) in 4,132 Parkinson’s disease patients and 4,470 controls. Furthermore, we analyzed data from a PD Genome Wide Association Study (GWAS) to examine the association of common variants in the PSAP locus with Parkinson’s disease risk (analysis on 56,308 patients) and age at onset (analysis on 28,568 patients). We did not find any statistically significant associations between neither rare nor common variants in saposin D, nor any of the other saposins, and PD risk or onset. These results suggest that PSAP variants play either a very minor role, or more likely, no role, in PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,169
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,132
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrainMême sujetLysosomal Storage Disorders ResearchTravaux en français237 207