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Enregistrement W3088401235 · doi:10.1038/s41586-020-2797-4

Cells of the adult human heart

2020· article· en· W3088401235 sur OpenAlexafffund
Monika Litviňuková, Carlos Talavera‐López, Henrike Maatz, Daniel Reichart, Catherine L. Worth, Eric L. Lindberg, Masatoshi Kanda, Krzysztof Polański, Matthias Heinig, Michael Lee, Emily R. Nadelmann, Kenny Roberts, Elizabeth Tuck, Eirini S. Fasouli, Daniel M. DeLaughter, Barbara McDonough, Hiroko Wakimoto, Joshua Gorham, Sara Samari, Krishnaa T. Mahbubani, Kourosh Saeb‐Parsy, Giannino Patone, Joseph J. Boyle, Hongbo Zhang, Hao Zhang, Anissa Viveiros, Gavin Y. Oudit, Omer Ali Bayraktar, Jonathan G. Seidman, Christine E. Seidman, Michela Noseda, Norbert Hübner, Sarah A. Teichmann

Notice bibliographique

RevueNature · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthAlberta InnovatesChina Scholarship CouncilBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsches Zentrum für Herz-KreislaufforschungEuropean CommissionUniversity of AlbertaDeutsche ForschungsgemeinschaftSarnoff Cardiovascular Research FoundationBritish Heart FoundationHoward Hughes Medical InstituteChan Zuckerberg InitiativeAlexander von Humboldt-StiftungWellcome TrustNational Heart, Lung, and Blood InstituteHeart and Stroke Foundation of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésTranscriptomeBiologyCell typeMyocyteImmune systemCellNeuroscienceHuman heartCardiac muscleCell biologyCardiac VentricleHeart diseaseGene expressionMedicinePathologyAnatomyGeneImmunologyInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiovascular disease is the leading cause of death worldwide. Advanced insights into disease mechanisms and therapeutic strategies require a deeper understanding of the molecular processes involved in the healthy heart. Knowledge of the full repertoire of cardiac cells and their gene expression profiles is a fundamental first step in this endeavour. Here, using state-of-the-art analyses of large-scale single-cell and single-nucleus transcriptomes, we characterize six anatomical adult heart regions. Our results highlight the cellular heterogeneity of cardiomyocytes, pericytes and fibroblasts, and reveal distinct atrial and ventricular subsets of cells with diverse developmental origins and specialized properties. We define the complexity of the cardiac vasculature and its changes along the arterio-venous axis. In the immune compartment, we identify cardiac-resident macrophages with inflammatory and protective transcriptional signatures. Furthermore, analyses of cell-to-cell interactions highlight different networks of macrophages, fibroblasts and cardiomyocytes between atria and ventricles that are distinct from those of skeletal muscle. Our human cardiac cell atlas improves our understanding of the human heart and provides a valuable reference for future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 771
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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