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Enregistrement W3107805681 · doi:10.5812/gct.110381

The Expression of Wnt5a Gene Throughout Definitive Endoderm Induction Process in Induced Pluripotent Stem Cells

2020· article· en· W3107805681 sur OpenAlexaff
Shahrokh Lorzadeh, Negar Azarpira, Saeid Ghavami, Leila Kohan

Notice bibliographique

RevueGene Cell and Tissue · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndodermHomeobox protein NANOGEctodermBiologyEmbryoid bodyWnt signaling pathwayInduced pluripotent stem cellFOXA2Cell biologyMesodermWNT5AGerm layerCellular differentiationStem cellEmbryonic stem cellMolecular biologyEmbryogenesisGeneticsEmbryoGeneSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Induced pluripotent stem cells (iPSCs) have the ability to proliferate indefinitely and differentiate into three germ layers of ectoderm, mesoderm, and endoderm. Definitive induction is the first and the most delicate stage of differentiation of various iPSC-derived organs. It has been found that the Wnt signaling pathway implicates in embryogenesis, organogenesis, and cell communication. Objectives: In the present study, we aimed to investigate the expression pattern of the Wnt5a gene as an indicator of non-canonical Wnt signaling activity during definitive endoderm induction of iPSCs. Methods: Human iPSCs (RSCB0042) were acquired from Royan stem cell bank of Royan Institute (Tehran, Iran). The iPSCs were cultured on a feeder layer of mitomycin-inactivated mouse embryonic fibroblasts (MEF), and iPSC colonies were collected for embryoid body (EB) generation by suspension culture method. Then endoderm induction step was performed using a series of small molecules. The quantitative real-time PCR was used to assess the mRNA expression of wnt5a, Nanog, OCT4, SOX17, and FOXA2 genes. Results: The production of efficient EBs confirmed by a decrease in Nanog and Oct4 gene expression and the success of DE (definite endoderm) induction step was confirmed by a high expression level of DE specific genes, Sox17, and FoxA2. A significant upregulation of Wnt5a in EB samples and a minor decrease at day 4 was observed. However, the differentiation process followed by an incremental fashion in Wnt5a mRNA expression starting from day 4 of differentiation among the samples of days 6 and 8 (DE stage). Conclusions: Our results suggest that Wnt5a is more activated at the later steps of endoderm induction rather than the early steps, which may be due to the stimulation of canonical Wnt signaling. Finding the expression level of Wnt5a could rise insights for developing more efficient differentiation induction protocols.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,506

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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