The Expression of Wnt5a Gene Throughout Definitive Endoderm Induction Process in Induced Pluripotent Stem Cells
Notice bibliographique
Résumé
Background: Induced pluripotent stem cells (iPSCs) have the ability to proliferate indefinitely and differentiate into three germ layers of ectoderm, mesoderm, and endoderm. Definitive induction is the first and the most delicate stage of differentiation of various iPSC-derived organs. It has been found that the Wnt signaling pathway implicates in embryogenesis, organogenesis, and cell communication. Objectives: In the present study, we aimed to investigate the expression pattern of the Wnt5a gene as an indicator of non-canonical Wnt signaling activity during definitive endoderm induction of iPSCs. Methods: Human iPSCs (RSCB0042) were acquired from Royan stem cell bank of Royan Institute (Tehran, Iran). The iPSCs were cultured on a feeder layer of mitomycin-inactivated mouse embryonic fibroblasts (MEF), and iPSC colonies were collected for embryoid body (EB) generation by suspension culture method. Then endoderm induction step was performed using a series of small molecules. The quantitative real-time PCR was used to assess the mRNA expression of wnt5a, Nanog, OCT4, SOX17, and FOXA2 genes. Results: The production of efficient EBs confirmed by a decrease in Nanog and Oct4 gene expression and the success of DE (definite endoderm) induction step was confirmed by a high expression level of DE specific genes, Sox17, and FoxA2. A significant upregulation of Wnt5a in EB samples and a minor decrease at day 4 was observed. However, the differentiation process followed by an incremental fashion in Wnt5a mRNA expression starting from day 4 of differentiation among the samples of days 6 and 8 (DE stage). Conclusions: Our results suggest that Wnt5a is more activated at the later steps of endoderm induction rather than the early steps, which may be due to the stimulation of canonical Wnt signaling. Finding the expression level of Wnt5a could rise insights for developing more efficient differentiation induction protocols.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».