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Enregistrement W3111421261 · doi:10.1038/s10038-020-00895-6

Variation in the SERPINA6/SERPINA1 locus alters morning plasma cortisol, hepatic corticosteroid binding globulin expression, gene expression in peripheral tissues, and risk of cardiovascular disease

2021· article· en· W3111421261 sur OpenAlexafffund
Andrew Crawford, Sean Bankier, Elisabeth Altmaier, Catriona L. K. Barnes, David W. Clark, Raili Ermel, Nele Friedrich, Pim van der Harst, Peter K. Joshi, Ville Karhunen, Jari Lahti, Anubha Mahajan, Massimo Mangino, Maria Nethander, Alexander Neumann, Maik Pietzner, Katyayani Sukhavasi, Carol A. Wang, Stephan J. L. Bakker, Johan Björkegren, Harry Campbell, Johan G. Eriksson, Christian Gieger, Caroline Hayward, Marjo‐Riitta Järvelin, Stela McLachlan, Andrew P. Morris, Claes Ohlsson, Craig E. Pennell, Jackie F. Price, Igor Rudan, Arno Ruusalepp, Tim D. Spector, Henning Tiemeier, Henry Völzke, James F. Wilson, Tom Michoel, Nicholas J. Timpson, George Davey Smith, Brian R. Walker, Dan Mellström

Notice bibliographique

RevueJournal of Human Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensJewish General HospitalCentre for Global Health Research
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchTerveyden ja hyvinvoinnin laitosNovo Nordisk FondenOulun YliopistoAkademiska SjukhusetGovernment of Western AustraliaHjärt-LungfondenMurdoch UniversitySocialdepartementetNational Institutes of HealthUniversity of Notre Dame AustraliaWomen and Infants Research FoundationZonMwRaine Medical Research FoundationNational Institute for Health and Care ResearchVetenskapsrådetAustralian GovernmentKing's College LondonNierstichtingUniversity of Notre DameBritish Heart FoundationScottish GovernmentCurtin University of TechnologyEuropean CommissionUppsala UniversitetErasmus Universiteit RotterdamEdith Cowan UniversityIcahn School of Medicine at Mount SinaiNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome TrustWellcome
Mots-clésExpression quantitative trait lociBiologyInternal medicineEndocrinologyGenome-wide association studyQuantitative trait locusSingle-nucleotide polymorphismLocus (genetics)Vitamin D-binding proteinGeneticsGenotypeMedicineGeneVitamin D and neurology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The stress hormone cortisol modulates fuel metabolism, cardiovascular homoeostasis, mood, inflammation and cognition. The CORtisol NETwork (CORNET) consortium previously identified a single locus associated with morning plasma cortisol. Identifying additional genetic variants that explain more of the variance in cortisol could provide new insights into cortisol biology and provide statistical power to test the causative role of cortisol in common diseases. The CORNET consortium extended its genome-wide association meta-analysis for morning plasma cortisol from 12,597 to 25,314 subjects and from ~2.2 M to ~7 M SNPs, in 17 population-based cohorts of European ancestries. We confirmed the genetic association with SERPINA6/SERPINA1. This locus contains genes encoding corticosteroid binding globulin (CBG) and α1-antitrypsin. Expression quantitative trait loci (eQTL) analyses undertaken in the STARNET cohort of 600 individuals showed that specific genetic variants within the SERPINA6/SERPINA1 locus influence expression of SERPINA6 rather than SERPINA1 in the liver. Moreover, trans-eQTL analysis demonstrated effects on adipose tissue gene expression, suggesting that variations in CBG levels have an effect on delivery of cortisol to peripheral tissues. Two-sample Mendelian randomisation analyses provided evidence that each genetically-determined standard deviation (SD) increase in morning plasma cortisol was associated with increased odds of chronic ischaemic heart disease (0.32, 95% CI 0.06-0.59) and myocardial infarction (0.21, 95% CI 0.00-0.43) in UK Biobank and similarly in CARDIoGRAMplusC4D. These findings reveal a causative pathway for CBG in determining cortisol action in peripheral tissues and thereby contributing to the aetiology of cardiovascular disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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