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Enregistrement W3122173354 · doi:10.1093/cid/ciab067

Transcontinental Dissemination of the L2b/D-Da Recombinant <i>Chlamydia trachomatis</i> Lymphogranuloma venereum (LGV) Strain: Need of Broad Multi-Country Molecular Surveillance

2021· article· en· W3122173354 sur OpenAlexaff
Vítor Borges, Joana Isidro, Cristina Belo Correia, Dora Cordeiro, Luı́s Vieira, Zohra Lodhia, Cândida Fernandes, Ana Maria Rodrigues, Jacinta Azevedo, João M. P. Alves, João Rôxo, Miguel Rocha, Rita Côrte‐Real, Cristina Toscano, Maria Ana Pessanha, Israel Nissan, Shlomo Pilo, Efrat Rorman, Zeev Dveyrin, Yossi Paitan, Haim Paran, Gal Wagner-Kolasko, Jennifer Beirnes, Suzanne Gibbons, Alberto Severini, Maria José Borrego, João Paulo Gomes

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesPrograma Operacional Temático Factores de Competitividade
Mots-clésLymphogranuloma venereumChlamydia trachomatisVirologyRecombinant DNAMen who have sex with menChlamydiaceaeMicrobiologyChlamydiaGenotypeStrain (injury)BiologyMedicineGeneGeneticsHuman immunodeficiency virus (HIV)SyphilisInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, we identified a Chlamydia trachomatis lymphogranuloma venereum (LGV) recombinant strain possessing a non-LGV ompA genotype. Here, culture-independent genome sequencing confirms its circulation in Europe, Middle East, and North America, and unveils emergence of antibiotic resistance. Broad surveillance is needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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