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Enregistrement W3126515736 · doi:10.1038/s41467-021-21204-5

PRMT5 inhibition disrupts splicing and stemness in glioblastoma

2021· article· en· W3126515736 sur OpenAlexafffund
Patty Sachamitr, Jolene Caifeng Ho, Felipe E. Ciamponi, Wail Ba-Alawi, Fiona J. Coutinho, Paul Guilhamon, Michelle Kushida, Florence M.G. Cavalli, Lilian Lee, Naghmeh Rastegar, Victoria Vu, María Sánchez‐Osuna, Jasmin Coulombe‐Huntington, Evgeny Kanshin, Heather Whetstone, Mathieu Durand, P Thibault, Kirsten Hart, Maria Mangos, Joseph Veyhl, Wenjun Chen, Nhat Tran, Bang-Chi Duong, Ahmed Aman, Xinghui Che, Xiaoyang Lan, Owen Whitley, Olga Zaslaver, Dalia Baršytė-Lovejoy, Laura M. Richards, Ian J. Restall, Amy A. Caudy, Hannes Röst, Zahid Bonday, Mark Bernstein, Sunit Das, Michael D. Cusimano, Julian Spears, Gary D. Bader, Trevor J. Pugh, Mike Tyers, Mathieu Lupien, Benjamin Haibe‐Kains, H. Artee Luchman, Samuel Weiss, Katlin B. Massirer, Panagiotis Prinos, C.H. Arrowsmith, Peter B. Dirks

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensVector InstituteSt. Michael's HospitalToronto Western HospitalHotchkiss Brain InstitutePrincess Margaret Cancer CentreUniversity of CalgaryOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoUniversité de SherbrookeHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalUniversity Health NetworkInstitute for Research in Immunology and CancerSickKids FoundationStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesMitacsSick Kids FoundationStand Up To CancerNovartis PharmaOntario Genomics InstituteGovernment of CanadaOntario Institute for Cancer ResearchUniversité de SherbrookeEntertainment Industry FoundationEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaACanada's Michael Smith Genome Sciences CentreOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceOntario GenomicsFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaHospital for Sick ChildrenPfizerGovernment of OntarioAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésProtein arginine methyltransferase 5Cancer researchTranscriptomeStem cellBiologyAlternative splicingRNA splicingGliomaCancer stem cellGeneMethyltransferaseBioinformaticsCell biologyExonGeneticsGene expressionMethylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma (GBM) is a deadly cancer in which cancer stem cells (CSCs) sustain tumor growth and contribute to therapeutic resistance. Protein arginine methyltransferase 5 (PRMT5) has recently emerged as a promising target in GBM. Using two orthogonal-acting inhibitors of PRMT5 (GSK591 or LLY-283), we show that pharmacological inhibition of PRMT5 suppresses the growth of a cohort of 46 patient-derived GBM stem cell cultures, with the proneural subtype showing greater sensitivity. We show that PRMT5 inhibition causes widespread disruption of splicing across the transcriptome, particularly affecting cell cycle gene products. We identify a GBM splicing signature that correlates with the degree of response to PRMT5 inhibition. Importantly, we demonstrate that LLY-283 is brain-penetrant and significantly prolongs the survival of mice with orthotopic patient-derived xenografts. Collectively, our findings provide a rationale for the clinical development of brain penetrant PRMT5 inhibitors as treatment for GBM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations217
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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