MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3127163105 · doi:10.1101/2021.02.09.429966

Human monoclonal antibodies against <i>Staphylococcus aureus</i> surface antigens recognize <i>in vitro</i> biofilm and <i>in vivo</i> implant infections

2021· preprint· en· W3127163105 sur OpenAlexaff
Lisanne de Vor, Bruce van Dijk, Kok P. M. van Kessel, J.S. Kavanaugh, Carla J. C. de Haas, Piet C. Aerts, Marco C. Viveen, Edwin Boel, Ad C. Fluit, Jakub Kwieciński, Gerard C. Krijger, Ruud M. Ramakers, Freek J. Beekman, Ekaterina Dadachova, Marnix G. E. H. Lam, H. Charles Vogely, Bart C. H. van der Wal, Jos A. G. van Strijp, Alexander R. Horswill, Harrie Weinans, Suzan H. M. Rooijakkers

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAmsterdam University Medical CentersUniversität KonstanzUniversitair Medisch Centrum UtrechtWageningen University and ResearchNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institutes of HealthUniversiteit LeidenHealth~Holland
Mots-clésBiofilmStaphylococcus aureusTeichoic acidMicrobiologyMonoclonal antibodyIn vivoAntibioticsIn vitroAntibodyBiologyStaphylococcal infectionsAntigenBacteriaChemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Implant-associated Staphylococcus aureus infections are difficult to treat because of biofilm formation. Bacteria in a biofilm are often insensitive to antibiotics and host immunity. Monoclonal antibodies (mAbs) could provide an alternative approach to improve the diagnosis and/or treatment of biofilm-related infections. Here we show that mAbs targeting common surface components of S. aureus can recognize clinically relevant biofilm types. We identify two groups of antibodies: one group that uniquely binds S. aureus in biofilm state and one that recognizes S. aureus in both biofilm and planktonic state. In a mouse model, we show that mAb 4497 (recognizing wall teichoic acid (WTA)) specifically localizes to biofilm-infected implants. In conclusion, we demonstrate the capacity of several human mAbs to detect S. aureus biofilms in vitro and in vivo . This is an important first step to develop mAbs for imaging or treating S. aureus biofilms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetBacterial biofilms and quorum sensing→Travaux en français237 207→