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Enregistrement W3138553809 · doi:10.1101/2021.03.25.437029

INPP4B drives lysosome biogenesis to restrict leukemic stem cell differentiation and promote leukemogenesis

2021· preprint· en· W3138553809 sur OpenAlexafffund
John F. Woolley, Keyue Chen, Golam T. Saffi, Gizem Esra Genç, Daniel K.C. Lee, Irakli Dzneladze, Ruijuan He, Jonathan Tak-Sum Chow, Martino Gabra, Meong Hi Son, Ché M.P. Melo, Candaice A. Newell, Aobo He, Erwin M. Schoof, Stephanie Z. Xie, Emily M. Mangialardi, Max Kotlyar, Ayesha Rashid, Miki S. Gams, Jean Vacher, Cynthia J. Guidos, Igor Jurišica, John E. Dick, Roberto J. Botelho, Mark D. Minden, Leonardo Salmena

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research InstituteHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkToronto Metropolitan UniversityUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchDiscovery Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of OntarioLeukemia and Lymphoma Society of CanadaUniversity of TorontoTemerty Faculty of Medicine, University of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchCanadian Institutes of Health ResearchLeukemia and Lymphoma Society
Mots-clésBiologyCancer researchStem cellLysosomeBiogenesisMyeloid leukemiaHaematopoiesisHematopoietic stem cellLeukemiaMechanism (biology)Cell biologyGeneImmunologyGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Signaling pathways that control vital features of leukemic stem cells including multipotency, self-renewal, clonal expansion and quiescence remain unclear. Emerging studies illustrate critical roles for lysosomes in hematopoietic and leukemic stem cell fate. By investigating consequences of INPP4B alterations in AML, we have discovered its role in driving leukemic ‘stemness’. We observed that INPP4B is highly expressed leukemic stem cell populations and Inpp4b -deficeint leukemias demonstrate increased disease latency, reduced leukemia initiating potential which is associated with a differentiated leukemic phenotype. Molecular analyses show that Inpp4b -deficient leukemias have compromised lysosomal gene expression, lysosomal content, and lysosomal activity. Our discovery of a novel pathway linking INPP4B, lysosomal biogenesis and leukemic stemness, provides a mechanism to explain the association of high INPP4B expression with poor AML prognosis, and highlights novel patient stratification strategies and LSC-specific leukemic therapies. Key Points Our findings highlight a novel pathway linking INPP4B, lysosomal function and leukemic stemness that explains the prognostic role of INPP4B in AML. Our data reveal the utility of INPP4B as a biomarker of aggressive AML and provide a rationale to explore INPP4B and its associated function in lysosome biology as novel strategies to target LSC and AML

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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