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Enregistrement W3155626750 · doi:10.18632/aging.202950

Multiomics integrative analysis identifies APOE allele-specific blood biomarkers associated to Alzheimer’s disease etiopathogenesis

2021· article· en· W3155626750 sur OpenAlexfundno aff
Laura Madrid, Sonia Moreno–Grau, Shahzad Ahmad, Antonio González-Pérez, Itziar de Rojas, Rui Xia, Pamela V. Martino Adami, Pablo García‐González, Luca Kleineidam, Qiong Yang, Vincent Damotte, Joshua C. Bis, Fuensanta Noguera-Perea, Céline Bellenguez, Xueqiu Jian, Juan Marín-Muñoz, Benjamin Grenier‐Boley, Adela Orellana, M. Arfan Ikram, Philippe Amouyel, Claudia L. Satizábal, Luís Miguel Real, Carmen Antúnez-Almagro, Anita L. DeStefano, Alfredo Cabrera‐Socorro, Rebecca Sims, Cornelia M. van Duijn, Eric Boerwinkle, Alfredo Ramı́rez, Myriam Fornage, Jean‐Charles Lambert, Julie Williams, Sudha Seshadri, Janina S. Ried, Agustı́n Ruiz, María Eugenia Sáez

Notice bibliographique

RevueAging · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Alzheimer Immunotherapy Research And DevelopmentJohnson and Johnson Pharmaceutical Research and DevelopmentNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIIMenzies Centre for Australian Studies, King's College London, University of LondonCambridge Institute for Medical Research, University of CambridgeNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeArizona Biomedical Research CommissionNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesIXICODevelopment of Innovative Strategies for a Transdisciplinary approach to ALZheimer's diseaseCentro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades NeurodegenerativasUniversité Pierre et Marie CurieUniversity of BristolH. Lundbeck A/SMeso Scale DiagnosticsAgence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de SantéSanofiFondation de FranceFonds Wetenschappelijk OnderzoekFondation pour la Recherche MédicaleBelgian Federal Science Policy OfficeUniversity College LondonAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMedical Research CouncilServierUniversität HeidelbergGenentechFondation pour la Recherche sur AlzheimerEuropean CommissionEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchPfizerInstituto de Investigación Marqués de ValdecillaVlaamse regeringUniversity of OxfordEisaiUniversity of Southern CaliforniaWellcome TrustEli Lilly and CompanyBrigham Young UniversityCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of SouthamptonUniversiteit AntwerpenNorthern California Institute for Research and EducationInstitute of GeneticsAgence Nationale de la RechercheBiogenBioClinicaAlzheimer's AssociationEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsArizona Department of Health ServicesF. Hoffmann-La RocheEmory UniversityCardiff UniversityU.S. Department of DefenseMutuelle Générale de l'Education NationaleBristol-Myers SquibbNational Center for Advancing Translational SciencesNovartis Pharmaceuticals CorporationAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn
Mots-clésApolipoprotein EDiseaseConcordanceAlleleGenome-wide association studyDementiaAlzheimer's diseaseBiologyOmicsComputational biologyBiomarkerBioinformaticsMedicineGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AD cases that could constitute screening tools for a disease that lacks specific blood biomarkers. Beside the identification of APOE-specific signatures, our findings advocate that this novel approach, based on the concordance across OMIC layers and tissues, is an effective strategy for overcoming the limitations of often underpowered single-OMICS studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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