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Enregistrement W3168209112 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.408.1

Lipid transporters and binding proteins; MsbA and NPC1

2010· article· en· W3168209112 sur OpenAlexaff
Frances J. Sharom

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNPC1EndosomeFlippaseATP-binding cassette transporterBiochemistryTransport proteinChemistrySterol regulatory element-binding proteinCell biologyMembrane proteinVesicleBiologySterolTransporterIntracellularMembraneCholesterolGenePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the molecular mechanism of proteins that translocate or transfer lipids presents a special challenge. The bacterial ABC protein, MsbA, is a homodimeric “half‐transporter” of known structure, which is thought to act as an outwardly‐directed ATP‐driven flippase for lipid A and possibly some phospholipids. We have purified MsbA with high ATPase activity and established its binding affinity for putative substrates using fluorescence spectroscopic tools. Reconstituted MsbA displays a high level of flippase activity for certain phospholipids, providing an excellent opportunity to explore the mechanism of lipid translocation at the molecular level. Mutations in NPC1 cause Niemann‐Pick Type C disease, a fatal neurodegenerative condition characterized by accumulation of cholesterol and glycolipids in the late endosomes. NPC1 is a 190 kDa integral protein found in the late endosomal membrane. It is known to be a key player in intracellular cholesterol trafficking, but the nature of its substrates and its exact role remain enigmatic. Recent studies on purified NPC1 have shown that it binds several sterols, and the binding site has been localized to the N‐terminal luminal domain, which has been crystallized in sterol‐bound form. NPC1 may accept sterol from NPC2, a small soluble protein in the lumen of late endosomes, and transfer it to either the membrane, or an as yet unidentified cytoplasmic acceptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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