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Enregistrement W3180735302 · doi:10.2215/cjn.00920121

Gene Expression Profiling in Kidney Transplants with Immune Checkpoint Inhibitor–Associated Adverse Events

2021· article· en· W3180735302 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueClinical Journal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNephrotoxicity and Medicinal Plants
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésMedicineImmune checkpointImmune systemCancer researchImmunologyImmunotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and objectives Immune checkpoint inhibitors are increasingly used to treat various malignancies, but their application in patients with kidney transplants is complicated by high allograft rejection rates. Immune checkpoint inhibitor–associated rejection is a novel, poorly understood entity demonstrating overlapping histopathologic features with immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis, which poses a challenge for diagnosis and clinical management. We sought to improve the understanding of these entities through biopsy-based gene expression analysis. Design, setting, participants, & measurements NanoString was used to measure and compare the expression of 725 immune-related genes in 75 archival kidney biopsies, including a 25-sample discovery cohort comprising pure T cell–mediated rejection and immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis and an independent 50-sample validation cohort comprising immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis, immune checkpoint inhibitor–associated T cell–mediated rejection, immune checkpoint inhibitor–associated crescentic GN, drug-induced acute interstitial nephritis, BK virus nephropathy, and normal biopsies. Results Significant molecular overlap was observed between immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis and T cell–mediated rejection. Nevertheless, IFI27 , an IFN- α– induced transcript, was identified and validated as a novel biomarker for differentiating immune checkpoint inhibitor–associated T cell–mediated rejection from immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis (validation cohort: P <0.001, area under the receiver operating characteristic curve =100%, accuracy =86%). Principal component analysis revealed heterogeneity in inflammatory gene expression patterns within sample groups; however, immune checkpoint inhibitor–associated T cell–mediated rejection and immune checkpoint inhibitor–associated acute interstitial nephritis both demonstrated relatively more molecular overlap with drug-induced acute interstitial nephritis than T cell–mediated rejection, suggesting potential dominance of hypersensitivity mechanisms in these entities. Conclusions These results indicate that, although there is significant molecular similarity between immune checkpoint inhibitor–associated rejection and acute interstitial nephritis, biopsy-based measurement of IFI27 gene expression represents a potential biomarker for differentiating these entities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,411
Score d'incertitude au seuil0,505

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle