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Enregistrement W3213956481 · doi:10.1085/jgp.2021ecc17

Structural basis for diamide modulation of ryanodine receptor

2021· article· en· W3213956481 sur OpenAlexafffund
Ruifang Ma, Omid Haji‐Ghassemi, Dan Ma, Heng Jiang, Lianyun Lin, Tong Xu, Takashi Murayama, Bernard Moussian, Filip Van Petegem, Zhiguang Yuchi

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Key Research and Development Program of ChinaCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCNational Natural Science Foundation of ChinaJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésRyanodine receptorRYR1BiologyIn silicoMutagenesisMutationBiochemistryDiamondback mothCell biologyBiophysicsReceptorChemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diamide insecticides target insect ryanodine receptors (RYRs) and cause dysregulation of calcium signaling in insect muscles and neurons, generating worldwide sales over 2 billion US dollars annually. Several resistance mutations have been reported to reduce the efficacy of the diamides, but the exact binding sites and mechanism of resistance mutations were not clear. Recently, we solved the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure of RYR in complex with the anthranilic diamide chlorantraniliprole (CHL). CHL binds to the pseudo–voltage-sensor domain (pVSD) of RYR, a site in proximity to the previously identified resistance mutations. Mutagenesis studies in silico, in mutant cell lines, and in transgenic Drosophila strains revealed the key residues involved in diamide coordination and the molecular mechanism under species-selectivity and resistance mutations. We also proposed that CHL may alleviate the loss-of-function effects of some central core disease (CCD) mutations by increasing the opening probability (Po) of RYR1. In addition, we solved the crystal structures of several RYR domains from the diamondback moth and the bee, revealing insect-specific structural features which could be potentially targeted by novel insecticides. Interestingly, we found that the phosphorylation of insect RYR is temperature dependent, facilitated by the low thermal stability and dynamic structure of the insect RYR. Our structures provide a foundation for developing novel pesticides to overcome the resistance crisis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,215

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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