Using Live Imaging and FUCCI Embryonic Stem Cells to Rank DevTox Risks: Adverse Growth Effects of PFOA Compared With DEP Are 26 Times Faster, 1,000 Times More Sensitive, and 13 Times Greater in Magnitude
Notice bibliographique
Résumé
Fluorescent ubiquitination-based cell cycle indicator (FUCCI) embryonic stem cells (ESCs), which fluoresce green during the S-G2-M phases, generate an S-shaped curve for the accumulation of cells during normal stemness (NS) culture with leukemia-inhibitory factor (LIF). Since it was hypothesized that a culture of ESCs was heterogeneous in the cell cycle, it was expected that increased S-G2-M-phases of the cell cycle would make an S-shaped curve parallel to the accumulation curve. Unexpectedly, it was observed that the fraction of FUCCI ESCs in green decreases over time to a nadir at ∼24 h after previous feeding and then rapidly enters S-G2-M-phases after medium change. G1 delay by infrequent medium change is a mild stress, as it does not affect growth significantly when frequency is increased to 12 h. Perfluoro-octanoic acid (PFOA) and diethyl phthalate (DEP) were used as examples of members of the per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) and phthalate families of chemicals, respectively. Two adverse outcomes were used to compare dose- and time-dependent effects of PFOA and DEP. The first was cell accumulation assay by time-lapse confluence measurements, largely at Tfinal/T74 h. The second was by quantifying dominant toxicant stress shown by the suppression of mild stress that creates a green fed/unfed peak. In terms of speed, PFOA is 26 times faster than DEP for producing a time-dependent LOAEL dose at 100 uM (that is, 2 h for PFOA and 52 h for DEP). PFOA has 1000-fold more sensitive LOAEL doses than DEP for suppressing ESC accumulation (confluence) at day 3 and day 2. There were two means to compare the magnitude of the growth suppression of PFOA and DEP. For the suppression of the accumulation of cells measured by confluence at Tfinal/T74h, there was a 13-fold suppression at the highest dose of PFOA > the highest dose of DEP. For the suppression of entry into the cell cycle after the G1 phase by stress on day 1 and 2, there is 10-fold more suppression by PFOA than DEP. The data presented here suggest that FUCCI ESCs can assay the suppression of accumulated growth or predict the suppression of future growth by the suppression of fed/unfed green fluorescence peaks and that PFOA's adverse effects are faster and larger and can occur at more sensitive lower doses than DEP.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».