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Enregistrement W4206349574 · doi:10.7554/elife.68174.sa2

Author response: Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor-based combination antiretroviral therapy is associated with lower cell-associated HIV RNA and DNA levels compared to protease inhibitor-based therapy

2021· peer-review· en· W4206349574 sur OpenAlexaff
Alexander Pasternak, Jelmer Vroom, Neeltje A. Kootstra, Ferdinand W.N.M. Wit, Marijn de Bruin, Davide De Francesco, Margreet Bakker, Caroline Sabin, Alan Winston, Jan M. Prins, Peter Reiss, Ben Berkhout, J. Schouten, KW Kooij, RA van Zoest, B C Elsenga, F R Janssen, M. Heidenrijk, W Zikkenheiner, Marc van der Valk, Thijs Booiman, A M Harskamp-Holwerda, Irma Maurer, MM Mangas Ruiz, AF Girigorie, Julien Villaudy, Esmay Frankin, AO Pasternak, T van der Kuyl, Peter Portegies, BA Schmand, Gert J. Geurtsen, JA ter Stege, M. Klein Twennaar, CBLM Majoie, MWA Caan, Tanja Su, Kees Weijer, P H L T Bisschop, Andries Kalsbeek, M Wezel, I. Visser, HG Ruhé, Claudio Franceschi, Paolo Garagnani, Chiara Pirazzini, Miriam Capri, Fabio Dall’Olio, Mariella Chiricolo, Stefano Salvioli, Jan H.J. Hoeijmakers, Joris Pothof, Maria Prins, M Martens, Solange Moll, J Berkel, M Totté, Sergey Y. Kovalev, Magnus Gisslén, Diana Fuchs, Henrik Zetterberg, Jonathan Underwood, L McDonald, Matthew A. Stott, Ken Legg, Andrew Lovell, Otto Erlwein, Nicki Doyle, Cherry Kingsley, DJ Sharp, Robert Leech, J. F. Cole, S Zaheri, M M J Hillebregt, Y M C Ruijs, D P Benschop, Dylan Burger, M de Graaff-Teulen, Giovanni Guaraldi, Alexander Bürkle, Thilo Sindlinger, María Moreno‐Villanueva, Amy Keller, Claude Libert, Sylviane Dewaele

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReverse transcriptaseReverse-transcriptase inhibitorNucleoside Reverse Transcriptase InhibitorProtease inhibitor (pharmacology)NucleosideRegimenRNAViral loadVirologyDNAAntiretroviral therapyHuman immunodeficiency virus (HIV)MedicineBiologyInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In two independent cohorts, NNRTI-based cART regimens are associated with significantly lower cell-associated HIV RNA levels than PI-based regimens, suggesting more potent suppression of residual virus replication by NNRTI-based regimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,165

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0490,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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