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Enregistrement W4206515520 · doi:10.1039/d1md00228g

Target 2035 – update on the quest for a probe for every protein

2021· editorial· en· W4206515520 sur OpenAlexafffund
Susanne Müller, Suzanne Ackloo, Arij Al Chawaf, Bissan Al‐Lazikani, Albert A. Antolín, Jonathan B. Baell, Hartmut Beck, Shaunna Beedie, Ulrich A. K. Betz, G.A. Bezerra, Paul E. Brennan, David A. Brown, Peter J. Brown, Alex N. Bullock, Adrian J. Carter, A. Chaikuad, Mathilde Chaineau, Alessio Ciulli, Ian Collins, Jan Dreher, David H. Drewry, Kristina Edfeldt, A.M. Edwards, Ursula Egner, Stephen V. Frye, Stephen M. Fuchs, Matthew D. Hall, Ingo V. Hartung, Alexander Hillisch, Stephen Hitchcock, Evert Homan, Natarajan Kannan, James R. Kiefer, Stefan Knapp, Milka Kostić, Stefan Kubicek, Andrew R. Leach, S. Lindemann, Brian D. Marsden, Hisanori Matsui, Jordan L. Meier, Daniel Merk, Maurice Michel, Maxwell R. Morgan, Anke Mueller‐Fahrnow, Dafydd R. Owen, Benjamin Perry, Saul H. Rosenberg, Kumar Singh Saikatendu, Matthieu Schapira, Cora Scholten, Sujata Sharma, Anton Simeonov, M. Sundström, Giulio Superti‐Furga, Matthew H. Todd, Claudia Tredup, Masoud Vedadi, F. von Delft, Timothy M. Willson, Georg E. Winter, Paul Workman, C.H. Arrowsmith

Notice bibliographique

RevueRSC Medicinal Chemistry · 2021
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensMcGill UniversityPrincess Margaret Cancer CentreMontreal Neurological Institute and HospitalStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesGenentechGeneralitat de CatalunyaNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKOntario Genomics InstituteMark Foundation For Cancer ResearchWellcome TrustMcGill UniversityRoyal Marsden NHS Foundation TrustPfizerEuropean CommissionChordoma FoundationOntario GenomicsGenome CanadaNational Cancer InstituteSeventh Framework ProgrammeEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsAgència per a la Competitivitat de l’EmpresaEuropean Molecular Biology LaboratoryMerck KGaAInnovative Medicines InitiativeWellcome
Mots-clésHuman proteome projectProteomeHuman genomeComputational biologyHuman proteinsBiologyGenomeProteomicsBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Twenty years after the publication of the first draft of the human genome, our knowledge of the human proteome is still fragmented. The challenge of translating the wealth of new knowledge from genomics into new medicines is that proteins, and not genes, are the primary executers of biological function. Therefore, much of how biology works in health and disease must be understood through the lens of protein function. Accordingly, a subset of human proteins has been at the heart of research interests of scientists over the centuries, and we have accumulated varying degrees of knowledge about approximately 65% of the human proteome. Nevertheless, a large proportion of proteins in the human proteome (∼35%) remains uncharacterized, and less than 5% of the human proteome has been successfully targeted for drug discovery. This highlights the profound disconnect between our abilities to obtain genetic information and subsequent development of effective medicines. Target 2035 is an international federation of biomedical scientists from the public and private sectors, which aims to address this gap by developing and applying new technologies to create by year 2035 chemogenomic libraries, chemical probes, and/or biological probes for the entire human proteome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,190
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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