MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4220718803 · doi:10.1038/s41380-022-01441-w

Meta-analysis of epigenome-wide associations between DNA methylation at birth and childhood cognitive skills

2022· review· en· W4220718803 sur OpenAlexafffund
Doretta Caramaschi, Alexander Neumann, Andrés Cárdenas, Gwen Tindula, Silvia Alemany, Lea Zillich, Giancarlo Pesce, Jari Lahti, Alexandra Havdahl, Rosa H. Mulder, Janine F. Felix, Henning Tiemeier, Lea Sirignano, Josef Frank, Stephanie H. Witt, Marcella Rietschel, Michael Deuschle, Karen Huen, Brenda Eskenazi, Tabea Send, Muriel Ferrer, Maria Gilles, Maria De Agostini, Nour Baïz, Sheryl L. Rifas‐Shiman, Tuomas Kvist, Darina Czamara, Samuli Tuominen, Caroline L. Relton, Dheeraj Rai, Stephanie J. London, Katri Räikkönen, Nina Holland, Isabella Annesi‐Maesano, Fabian Streit, Marie‐France Hivert, Emily Oken, Jordi Sunyer, Charlotte A. M. Cecil, Gemma C. Sharp

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2022
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesHelse Sør-Øst RHFInstituto de Salud Carlos IIINational Institutes of HealthEconomic and Social Research CouncilMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaInstitut pour la Recherche en Santé PubliqueNovo Nordisk FondenMutuelle Générale de l'Education NationaleAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailMedical Research CouncilSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöNational Institute on Drug AbuseNovo NordiskJuho Vainion SäätiöCanadian Institutes of Health ResearchYrjö Jahnssonin SäätiöJane ja Aatos Erkon SäätiöNational Institute of Mental HealthFondation pour la Recherche MédicaleGeneralitat de CatalunyaBundesministerium für Bildung und ForschungPäivikki ja Sakari Sohlbergin SäätiöSuomen Lääketieteen SäätiöAcademy of FinlandErasmus Universiteit RotterdamEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentZonMwInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNorges ForskningsrådErasmus Medisch CentrumCentres de Recerca de CatalunyaUniversity of BristolDeutsche ForschungsgemeinschaftHelsingin YliopistoEuropean CommissionJalmari ja Rauha Ahokkaan SäätiöJoint Programming Initiative A healthy diet for a healthy lifeNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekCHIST-ERAAgence Nationale de la RechercheBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome TrustFundació la Marató de TV3Université Paris-SudEmil Aaltosen SäätiöFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésEpigeneticsEpigenomeDNA methylationCognitionCpG siteCord bloodPsychologyPopulationGeneticsDevelopmental psychologyBiologyMedicineNeuroscienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cognitive skills are a strong predictor of a wide range of later life outcomes. Genetic and epigenetic associations across the genome explain some of the variation in general cognitive abilities in the general population and it is plausible that epigenetic associations might arise from prenatal environmental exposures and/or genetic variation early in life. We investigated the association between cord blood DNA methylation at birth and cognitive skills assessed in children from eight pregnancy cohorts within the Pregnancy And Childhood Epigenetics (PACE) Consortium across overall (total N = 2196), verbal (total N = 2206) and non-verbal cognitive scores (total N = 3300). The associations at single CpG sites were weak for all of the cognitive domains investigated. One region near DUSP22 on chromosome 6 was associated with non-verbal cognition in a model adjusted for maternal IQ. We conclude that there is little evidence to support the idea that variation in cord blood DNA methylation at single CpG sites is associated with cognitive skills and further studies are needed to confirm the association at DUSP22.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,012
Bibliométrie0,0030,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular PsychiatryMême sujetHealth, Environment, Cognitive AgingTravaux en français237 207