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Enregistrement W4223489001 · doi:10.1038/s41398-022-01884-3

Genome-wide association analyses of symptom severity among clozapine-treated patients with schizophrenia spectrum disorders

2022· article· en· W4223489001 sur OpenAlexafffund
Cynthia Okhuijsen‐Pfeifer, Marte Z. van der Horst, Chad Bousman, Bochao Lin, Kristel R. van Eijk, Stephan Ripke, Yavuz Ayhan, Melih O. Babaoğlu, Maarten Bak, Wouter Alink, Hanneke van Beek, Edwin Beld, Alde Bouhuis, Monika Edlinger, İbrahim Mert Erdoğan, Aygün Ertuğrul, Gökhan Yoca, Ian Everall, Thomas Görlitz, Thérèse van Amelsvoort, Agna A. Bartels‐Velthuis, Richard Bruggeman, Wiepke Cahn, Sinan Gülöksüz, Lieuwe de Haan, R.S. Kahn, Frederike Schirmbeck, Claudia J.P. Simons, Jim van Os, B.Z. Alizadeh, Jurjen J. Luykx, Bart P. F. Rutten, Ruud van Winkel, Koen P. Grootens, Stefan Gutwinski, Tero Hallikainen, Ellen Jeger-Land, Martijn de Koning, Markku Lähteenvuo, Sophie E. Legge, Stefan Leucht, C. Morgenroth, Ahmet Müderrisoğlu, Ankita Narang, Christos Pantelis, Antonio F. Pardiñas, Tatiana Oviedo-Salcedo, Johannes Schneider‐Thoma, Stefanie Schreiter, Eila Repo‐Tiihonen, Heli Tuppurainen, Mike Veereschild, Selene Veerman, M. de Vos, Elias Wagner, Dan Cohen, Jan Bogers, James Walters, A. Elif Anıl Yağcıoğlu, Jari Tiihonen, A. Hasan

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSchizophrenia research and treatment
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilAlberta InnovatesAcademy of Medical Sciences
Mots-clésSchizophrenia spectrumClozapineSchizophrenia (object-oriented programming)PsychiatryGenome-wide association studyAssociation (psychology)MedicineClinical psychologyPsychologyPsychosisSingle-nucleotide polymorphismGeneticsPsychotherapistGenotypeGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clozapine is the most effective antipsychotic for patients with treatment-resistant schizophrenia. However, response is highly variable and possible genetic underpinnings of this variability remain unknown. Here, we performed polygenic risk score (PRS) analyses to estimate the amount of variance in symptom severity among clozapine-treated patients explained by PRSs (R2) and examined the association between symptom severity and genotype-predicted CYP1A2, CYP2D6, and CYP2C19 enzyme activity. Genome-wide association (GWA) analyses were performed to explore loci associated with symptom severity. A multicenter cohort of 804 patients (after quality control N = 684) with schizophrenia spectrum disorder treated with clozapine were cross-sectionally assessed using the Positive and Negative Syndrome Scale and/or the Clinical Global Impression-Severity (CGI-S) scale. GWA and PRS regression analyses were conducted. Genotype-predicted CYP1A2, CYP2D6, and CYP2C19 enzyme activities were calculated. Schizophrenia-PRS was most significantly and positively associated with low symptom severity ( p = 1.03 × 10 −3 ; R2 = 1.85). Cross-disorder-PRS was also positively associated with lower CGI-S score ( p = 0.01; R2 = 0.81). Compared to the lowest tertile, patients in the highest schizophrenia-PRS tertile had 1.94 times ( p = 6.84×10 −4 ) increased probability of low symptom severity. Higher genotype-predicted CYP2C19 enzyme activity was independently associated with lower symptom severity ( p = 8.44×10 −3 ). While no locus surpassed the genome-wide significance threshold, rs1923778 within NFIB showed a suggestive association ( p = 3.78×10 −7 ) with symptom severity. We show that high schizophrenia-PRS and genotype-predicted CYP2C19 enzyme activity are independently associated with lower symptom severity among individuals treated with clozapine. Our findings open avenues for future pharmacogenomic projects investigating the potential of PRS and genotype-predicted CYP - activity in schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,985

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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