MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4225378684 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r3915

The MCF Toxin of the Extracellular Pathogen <i>Vibrio vulnificus</i> is Activated by and Targets Host GTPases

2022· article· en· W4225378684 sur OpenAlexaff
Alfa Herrera, Megan M. Packer, John H. Brumell, Karla Satchell

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVibrio vulnificusMicrobiologyVirulencePathogenEffectorBiologyVirulence factorToxinExtracellularSepsisSecretionBacteriaImmunologyGeneCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vibrio vulnificus ( Vv ) is a Gram‐negative bacterial pathogen typically found in warm coastal waters. This pathogen causes severe life‐threatening gastrointestinal and wound infections, most commonly from the consumption of contaminated seafood or an exposed wound. Infections progress quickly to sepsis, and death; approximately 90% of patients are hospitalized and >50% die, often as fast as 48 hours after symptom onset. Of concern, the incidence of Vv is increasing, in part due to its expanding geographical distribution caused by climate change. Bacterial pathogens cause debilitating and lethal infections that are often difficult to treat. Understanding how to manage and control the infections they cause is immensely important for improving quality of life and preventing death. The toxins secreted by extracellular bacteria are frequently the primary virulence factors required to either establish colonization, promote maintenance, growth, and/or eventually dissemination. As such bacterial toxins are extremely important in pathogenesis, and they affect and manipulate many host cellular processes. The primary Vv virulence factor associated with sepsis and subsequent death is the composite MARTX toxin. The MARTX toxin is secreted as a single large polypeptide composed of glycine‐rich repeats at both the N‐ and C‐termini between which there are up to five variable effector domains and a cysteine protease domain (CPD). The repeat regions form a pore in the plasma membrane and the effectors and CPD are translocated across. Within the cell, the CPD auto‐cleaves at multiple sites to release each of the arrayed effectors individually into the host cytoplasm. The MARTX toxin thus serves as an effector delivery platform for translocation of multiple toxic virulence factors inside cells as a single bolus. The Makes Caterpillars Floppy‐like (MCF) effector domain is among the most commonly present Vv MARTX effector domains. MCF is unique from most other MARTX domains in that it utilizes its own autoproteolytic activity to activate itself once inside the host cell. MCF autoprocessing requires stimulation by host ARFs, small GTPases that cycle between GDP‐ or GTP‐bound forms and localize to specific subcellular locations. Once auto‐processed, MCF binds phosphatidylinositol‐5‐phosphate (PtdIns5P), a lipid enriched on Golgi membranes, and its exposed N‐terminal glycine is acetylated. Combined, this results in the generation of “active” MCF (aMCF). aMCF induces the intrinsic apoptotic pathway, causes cell rounding, and nuclear fragmentation. Furthermore, aMCF causes vesiculation of the Golgi apparatus, and destroys the mitochondria. Remarkably, while ARF stimulated autoprocessing results in aMCF, ARFs are not the direct target leading to the cytotoxic effects. The biochemical link between the activation of MCF and its cytotoxicity remains unknown. We explore how MCF activation leads to its disruption of host endocytic trafficking proteins. We examine how these proteins may be targeted and modified by MCF. Furthermore, we assess how the disruption of these host proteins ultimately leads to the dissolution of the endomembrane signaling network and the cytotoxicity we observe. This study begins to elucidate the biochemical activity of this important domain and gives insight into how it may promote disease progression. This work will be critical for advancing the understanding how these MARTX toxins function during Vv pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetVibrio bacteria research studiesTravaux en français237 207