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Enregistrement W4281388536 · doi:10.1053/j.gastro.2022.05.029

Neutralizing Anti-Granulocyte Macrophage-Colony Stimulating Factor Autoantibodies Recognize Post-Translational Glycosylations on Granulocyte Macrophage-Colony Stimulating Factor Years Before Diagnosis and Predict Complicated Crohn’s Disease

2022· article· en· W4281388536 sur OpenAlexafffund
Arthur Mortha, Romain Remark, Diane M. Del Valle, Ling-Shiang Chuang, Zhi Chai, Inês Alves, Catarina M. Azevedo, Joana Gaifem, J.P. Martin, Francesca Petralia, Kevin Tuballes, Vanessa Barcessat, Siu Ling Tai, Hsin-Hui Huang, Ilaria Laface, Yeray Arteaga Jerez, Gilles Boschetti, Nicole Villaverde, Mona D. Wang, Ujunwa Korie, Joseph Murray, Rok-Seon Choung, Takahiro Sato, Renée M. Laird, Scott E. Plevy, Adeeb Rahman, Joana Torres, Chad Porter, Mark S. Riddle, Ephraim Kenigsberg, Salomé S. Pinho, Judy H. Cho, Miriam Mérad, Jean‐Frédéric Colombel, Sacha Gnjatic

Notice bibliographique

RevueGastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesU.S. Army Medical Research Acquisition ActivityJanssen PharmaceuticalsJanssen Research and DevelopmentNational Cancer InstitutePfizerNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTakeda CanadaCanadian Institutes of Health ResearchU.S. NavyGenentechFundação para a Ciência e a TecnologiaFerring PharmaceuticalsNational Institutes of HealthCanada Research ChairsGovernment of South AustraliaCrohn's and Colitis FoundationLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustNaval Medical Research CenterSanford J. Grossman Charitable TrustU.S. Department of DefenseNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSanofiShireBristol-Myers SquibbCrohn's and Colitis Foundation of AmericaUniversity of TorontoKenneth Rainin FoundationAbbVie CanadaBoehringer Ingelheim
Mots-clésGranulocyte macrophage colony-stimulating factorMedicineGranulocyteGranulocyte macrophage colony-stimulating factor receptorImmunologyMacrophageColony-stimulating factorAutoantibodyMacrophage colony-stimulating factorAntibodyBiologyCytokineHaematopoiesisIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & AIMS: Anti-granulocyte macrophage-colony stimulating factor autoantibodies (aGMAbs) are detected in patients with ileal Crohn's disease (CD). Their induction and mode of action during or before disease are not well understood. We aimed to investigate the underlying mechanisms associated with aGMAb induction, from functional orientation to recognized epitopes, for their impact on intestinal immune homeostasis and use as a predictive biomarker for complicated CD. METHODS: We characterized using enzyme-linked immunosorbent assay naturally occurring aGMAbs in longitudinal serum samples from patients archived before the diagnosis of CD (n = 220) as well as from 400 healthy individuals (matched controls) as part of the US Defense Medical Surveillance System. We used biochemical, cellular, and transcriptional analysis to uncover a mechanism that governs the impaired immune balance in CD mucosa after diagnosis. RESULTS: Neutralizing aGMAbs were found to be specific for post-translational glycosylation on granulocyte macrophage-colony stimulating factor (GM-CSF), detectable years before diagnosis, and associated with complicated CD at presentation. Glycosylation of GM-CSF was altered in patients with CD, and aGMAb affected myeloid homeostasis and promoted group 1 innate lymphoid cells. Perturbations in immune homeostasis preceded the diagnosis in the serum of patients with CD presenting with aGMAb and were detectable in the noninflamed CD mucosa. CONCLUSIONS: Anti-GMAbs predict the diagnosis of complicated CD long before the diagnosis of disease, recognize uniquely glycosylated epitopes, and impair myeloid cell and innate lymphoid cell balance associated with altered intestinal immune homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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