MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4286110847 · doi:10.1021/acssynbio.2c00160

Malarial Antibody Detection with an Engineered Yeast Agglutination Assay

2022· article· en· W4286110847 sur OpenAlexafffund
Criselda Jean G. Cruz, Richard Kil, Stanley Sau Ching Wong, Louis Dacquay, Denise Mirano‐Bascos, Pilarita T. Rivera, David R. McMillen

Notice bibliographique

RevueACS Synthetic Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesPhilippine Council for Health Research and DevelopmentNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGrand Challenges Canada
Mots-clésMalariaAgglutination (biology)Plasmodium falciparumAntibodyBiologyParasitemiaYeastMicrobiologyVirologyAntigenImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malaria, a disease caused by the Plasmodium parasite carried by Anopheles mosquitoes, is commonly diagnosed by microscopy of peripheral blood smears and with rapid diagnostic tests. Both methods show limited detection of low parasitemia that may maintain transmission and hinder malaria elimination. We have developed a novel agglutination assay in which modified Saccharomyces cerevisiae cells act as antigen-displaying bead-like particles to capture malaria antibodies. The Epidermal Growth Factor-1 like domain (EGF1) of the Plasmodium falciparum merozoite surface protein-1 (PfMSP-1 19 ) was displayed on the yeast surface and shown to be capable of binding antimalaria antibodies. Mixed with a second yeast strain displaying the Z domain of Protein A from Staphylococcus aureus and allowed to settle in a round-bottomed well, the yeast produce a visually distinctive agglutination test result: a tight “button” at a low level of malarial antibodies, and a diffuse “sheet” when higher antibody levels are present. Positive agglutination results were observed in malaria-positive human serum to a serum dilution of 1:100 to 1:125. Since the yeast cells are inexpensive to produce, the test may be amenable to local production in regions seeking malaria surveillance information to guide their elimination programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueACS Synthetic BiologyMême sujetViral Infectious Diseases and Gene Expression in InsectsTravaux en français237 207