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Enregistrement W4289948950 · doi:10.1016/j.nicl.2022.103144

Detection of emerging neurodegeneration using Bayesian linear mixed-effect modeling

2022· article· en· W4289948950 sur OpenAlexfundno aff
Yann Cobigo, Matthew S. Goh, Amy Wolf, Adam M. Staffaroni, John Kornak, Bruce L. Miller, Gil D. Rabinovici, William W. Seeley, Salvatore Spina, Adam L. Boxer, Bradley F. Boeve, Lei Wang, Ricardo Allegri, Marty Farlow, Hiroshi Mori, Richard J. Perrin, Joel H. Kramer, Howard J. Rosen

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchSchool of Public Health, University of California BerkeleyAllerganNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOServierH. Lundbeck A/SDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenEisaiKorea Health Industry Development InstituteVoyager TherapeuticsNorthern California Institute for Research and EducationJapan Agency for Medical Research and DevelopmentPfizerBiogenBioClinicaWeill Institute for Neurosciences, University of California, San FranciscoFleniTakeda Pharmaceuticals U.S.A.AbbVieJohnson and JohnsonVerily Life SciencesMeso Scale DiagnosticsTeva Pharmaceutical IndustriesUniversity of Southern CaliforniaCelgeneMerckGlaxoSmithKlineNovartis Pharmaceuticals CorporationNational Institutes of HealthAssociation for Frontotemporal DegenerationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeSanofiFujirebio USAlzheimer's AssociationF. Hoffmann-La RocheGenentechLarry L. Hillblom FoundationHDL TherapeuticsMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésNeurodegenerationBayesian probabilityComputer scienceArtificial intelligenceMedicineDiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early detection of neurodegeneration, and prediction of when neurodegenerative diseases will lead to symptoms, are critical for developing and initiating disease modifying treatments for these disorders. While each neurodegenerative disease has a typical pattern of early changes in the brain, these disorders are heterogeneous, and early manifestations can vary greatly across people. Methods for detecting emerging neurodegeneration in any part of the brain are therefore needed. Prior publications have described the use of Bayesian linear mixed-effects (BLME) modeling for characterizing the trajectory of change across the brain in healthy controls and patients with neurodegenerative disease. Here, we use an extension of such a model to detect emerging neurodegeneration in cognitively healthy individuals at risk for dementia. We use BLME to quantify individualized rates of volume loss across the cerebral cortex from the first two MRIs in each person and then extend the BLME model to predict future values for each voxel. We then compare observed values at subsequent time points with the values that were expected from the initial rates of change and identify voxels that are lower than the expected values, indicating accelerated volume loss and neurodegeneration. We apply the model to longitudinal imaging data from cognitively normal participants in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI), some of whom subsequently developed dementia, and two cognitively normal cases who developed pathology-proven frontotemporal lobar degeneration (FTLD). These analyses identified regions of accelerated volume loss prior to or accompanying the earliest symptoms, and expanding across the brain over time, in all cases. The changes were detected in regions that are typical for the likely diseases affecting each patient, including medial temporal regions in patients at risk for Alzheimer's disease, and insular, frontal, and/or anterior/inferior temporal regions in patients with likely or proven FTLD. In the cases where detailed histories were available, the first regions identified were consistent with early symptoms. Furthermore, survival analysis in the ADNI cases demonstrated that the rate of spread of accelerated volume loss across the brain was a statistically significant predictor of time to conversion to dementia. This method for detection of neurodegeneration is a potentially promising approach for identifying early changes due to a variety of diseases, without prior assumptions about what regions are most likely to be affected first in an individual.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,655
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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