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Enregistrement W4296130467 · doi:10.1158/1557-3265.sarcomas22-a031

Abstract A031: Interplay of YAP1, β-catenin and the SS18-SSX fusion protein in synovial sarcoma

2022· article· en· W4296130467 sur OpenAlexaboutno aff
Ilka Isfort, Ruth Berthold, Lorena Heinst, Eva Wardelmann, Marcel Trautmann, Wolfgang Hartmann

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésYAP1Gene knockdownBiologyLuciferaseCancer researchFusion proteinImmunoprecipitationFusion geneCateninWnt signaling pathwayTranscription factorMolecular biologyCell biologyCell cultureTransfectionSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Synovial sarcoma (SySa) is a rare soft-tissue malignancy characterized by a specific chromosomal translocation t(X;18). The resulting chimeric SS18-SSX fusion protein drives SySa pathogenesis by dysregulating gene transcription. As therapeutic targeting of SS18-SSX is notoriously difficult, the identification of SS18-SSX-dependent pathomechanisms may uncover novel molecular vulnerabilities. Since previous functional analyses revealed a connection between SS18-SSX and the activity of the transcriptional co-regulators YAP1/TAZ and β-catenin, this study examined a potential crosstalk between these effectors in SySa. Experimental Procedures: Nuclear abundance of YAP1/TAZ and β-catenin was analyzed by immunohistochemistry in a large cohort of SySa tissue specimens. Two SySa cell lines were employed to modulate YAP1/TAZ/β-catenin transcriptional activity by RNAi-mediated knockdown, small molecule inhibitors, and overexpression vectors in vitro. Changes in transcriptional activity were determined via luciferase reporter assays. As YAP1 and β-catenin showed highest interdependence, co-immunoprecipitation experiments were performed to investigate their interplay with the SS18-SSX fusion protein in SySa cells. Results: Immunohistochemically, a substantial subset of SySa tissue specimens showed concurrent nuclear accumulation of YAP1/TAZ and β-catenin. In vitro, SS18-SSX was found to promote YAP1/TAZ and β-catenin transcriptional activity. RNAi-mediated knockdown of YAP1, TAZ or β-catenin and small molecule inhibitor treatment mutually downregulated TEAD and TCF luciferase reporter activity, while expression of hyperactive variants led to a reciprocal luciferase reporter induction. Finally, co-immunoprecipitation assays demonstrated nuclear co-localization of SS18-SSX with YAP1 and β-catenin in SySa cell lines. Conclusions: This study reveals an interdependency between YAP1 and β-catenin activation and a complex interplay with the SySa-specific SS18-SSX fusion protein. Citation Format: Ilka Isfort, Ruth Berthold, Lorena Heinst, Eva Wardelmann, Marcel Trautmann, Wolfgang Hartmann. Interplay of YAP1, β-catenin and the SS18-SSX fusion protein in synovial sarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Sarcomas; 2022 May 9-12; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2022;28(18_Suppl):Abstract nr A031.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,389 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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