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Enregistrement W4296130467 · doi:10.1158/1557-3265.sarcomas22-a031

Abstract A031: Interplay of YAP1, β-catenin and the SS18-SSX fusion protein in synovial sarcoma

2022· article· en· W4296130467 sur OpenAlexaboutno aff
Ilka Isfort, Ruth Berthold, Lorena Heinst, Eva Wardelmann, Marcel Trautmann, Wolfgang Hartmann

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésYAP1Gene knockdownBiologyLuciferaseCancer researchFusion proteinImmunoprecipitationFusion geneCateninWnt signaling pathwayTranscription factorMolecular biologyCell biologyCell cultureTransfectionSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Synovial sarcoma (SySa) is a rare soft-tissue malignancy characterized by a specific chromosomal translocation t(X;18). The resulting chimeric SS18-SSX fusion protein drives SySa pathogenesis by dysregulating gene transcription. As therapeutic targeting of SS18-SSX is notoriously difficult, the identification of SS18-SSX-dependent pathomechanisms may uncover novel molecular vulnerabilities. Since previous functional analyses revealed a connection between SS18-SSX and the activity of the transcriptional co-regulators YAP1/TAZ and β-catenin, this study examined a potential crosstalk between these effectors in SySa. Experimental Procedures: Nuclear abundance of YAP1/TAZ and β-catenin was analyzed by immunohistochemistry in a large cohort of SySa tissue specimens. Two SySa cell lines were employed to modulate YAP1/TAZ/β-catenin transcriptional activity by RNAi-mediated knockdown, small molecule inhibitors, and overexpression vectors in vitro. Changes in transcriptional activity were determined via luciferase reporter assays. As YAP1 and β-catenin showed highest interdependence, co-immunoprecipitation experiments were performed to investigate their interplay with the SS18-SSX fusion protein in SySa cells. Results: Immunohistochemically, a substantial subset of SySa tissue specimens showed concurrent nuclear accumulation of YAP1/TAZ and β-catenin. In vitro, SS18-SSX was found to promote YAP1/TAZ and β-catenin transcriptional activity. RNAi-mediated knockdown of YAP1, TAZ or β-catenin and small molecule inhibitor treatment mutually downregulated TEAD and TCF luciferase reporter activity, while expression of hyperactive variants led to a reciprocal luciferase reporter induction. Finally, co-immunoprecipitation assays demonstrated nuclear co-localization of SS18-SSX with YAP1 and β-catenin in SySa cell lines. Conclusions: This study reveals an interdependency between YAP1 and β-catenin activation and a complex interplay with the SySa-specific SS18-SSX fusion protein. Citation Format: Ilka Isfort, Ruth Berthold, Lorena Heinst, Eva Wardelmann, Marcel Trautmann, Wolfgang Hartmann. Interplay of YAP1, β-catenin and the SS18-SSX fusion protein in synovial sarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Sarcomas; 2022 May 9-12; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2022;28(18_Suppl):Abstract nr A031.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,474
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,453
Écart entre enseignants0,389 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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