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Enregistrement W4296299315 · doi:10.26685/urncst.395

Effects of Procainamide on CTLA-4 and CD28 Expression in Drug-Induced Lupus: A Research Protocol

2022· article· en· W4296299315 sur OpenAlexafffund
Rachel Kim, Nishaad C. Sheth

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcMaster UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesUniversity of Ottawa
Mots-clésCD28ProcainamideSystemic lupus erythematosusCTLA-4ImmunologyAntigenBiologyMedicineMolecular biologyChemistryCancer researchT cellInternal medicineImmune systemDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Lupus erythematosus is a chronic autoimmune disease affecting over 5 million individuals worldwide, characterized by overactivation of B and T lymphocytes. Of these, 10% of patients are diagnosed with drug- induced lupus (DIL), which is caused by high doses of medications such as procainamide, with 20% of procainamide users developing DIL. CTLA-4 and CD28 receptors on T-cell surfaces bind to B7 proteins on antigen-presenting cells, halting and promoting T-cell activation, respectively. Studies indicate that certain lupus symptoms are linked to abnormal CTLA-4/CD28 expression, resulting in overreactive CD4+ T-cells. However, the exact nature of the relationship between CTLA-4 and lupus remains nonunanimous. Other studies show that procainamide alters DNA methylation7, while altered CTLA-4 methylation has been tied to autoimmune disorders. Thus, we hypothesize that procainamide leads to reduced CTLA-4 expression and/or increased CD28 expression, causing DIL symptoms. Methods: We propose an in vivo experiment involving time-matched mouse models. CITE-seq analyses would be run on isolated T-cells from the splenic samples to obtain transcriptome and epitope data and to examine the expression of CTLA-4, CD28, and other potential genes of interest. To corroborate CITE-seq results, the T-cells would undergo immunohistochemical staining with primary and fluorescent antibodies that bind to CTLA-4/CD28. Expected Results: Results are expected to indicate decreased CTLA-4 gene and protein expression, or increased CD28 gene and protein expression on the surface of procainamide-treated T-cells. Discussion: If our analyses prove successful, potential next steps involve using gene editing technologies to screen, pinpoint, and correct the molecular mechanisms implicated in procainamide-induced DIL. Further analysis may also implicate additional or other genes of interest involved in the etiology of the disease. Conclusion: This study is expected to provide insight into the effect of procainamide on molecular mechanisms involved in DIL. Further applications may involve adjunct therapies aimed at mitigating or preventing the development of DIL symptoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,061

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0180,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,371 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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