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Enregistrement W4309018553 · doi:10.1093/neuonc/noac209.1144

MODL-16. SOMATICALLY ENGINEERED MOUSE MODELS RECAPITULATING CELLULAR AND MOLECULAR FEATURES OF HUMAN GBM

2022· article· en· W4309018553 sur OpenAlexaff
Joanna Pyczek, Bo Young Ahn, Heewon Seo, Samuel O. Lawn, Shannon Snelling, Katalin Osz, Robyn Flynn, A. Sorana Morrissy, Jennifer A. Chan

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENBiologyCDKN2ACancer researchPDGFRAContext (archaeology)PhenotypeMesenchymal stem cellPathologyStromal cellPI3K/AKT/mTOR pathwayGeneGeneticsMedicineSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract INTRODUCTION Mouse models are instrumental in advancing our understanding of glioblastoma (GBM), however many commonly used models have features that limit their practicality or applicability. These limitations can include an incomplete immune context, a requirement for complex breeding strategies, high cost of specialized lines, and unpredictability in where tumors arise. We sought to develop and validate a mouse modeling system for some of the major human GBM subtypes that overcame these practical challenges. METHODS In vivo electroporation was used to introduce genetic alterations into periventricular cells of early postnatal C57Bl6/j mice. PiggyBac transposon/transposase and CRISPR-Cas9 systems were used to overexpress (OE) or knock out (KO) genes associated with mesenchymal (Nf1-KO/Pten-KO/p53-KO), classical (EGFRvIII-OE/Cdkn2a-KO/Pten-KO), and proneural (Pdgfra-OE/Cdk4-OE/p53-KO) IDH-WT GBM subtypes. KO or OE was confirmed by Indel Detection by Amplicon Analysis and immunofluorescent staining (IF). Tumours were analyzed for histologic, immunohistochemical, and transcriptional (RNAseq) features. RESULTS Tumors arose with near complete penetrance and median survivals of 36 to 116 days amongst models. All tumors were GFAP-expressing high-grade gliomas, with distinct phenotypes associated with different genetic combinations. Nf1-KO/Pten-KO/p53-KO tumors were composed of spindle cells. EGFRvIII-OE/Cdkn2a-KO/Pten-KO and Pdgfra-OE/Cdk4-OE/p53-KO tumors showed prevalence of small, round cells. Molecularly, Nf1-KO/Pten-KO/p53-KO tumors were enriched for human mesenchymal signature and displayed more differentiated phenotype. The Nf1-KO/Pten-KO/p53-KO model also showed increased stromal cells and macrophages. The other models had mixed proneural and classical profiles and were enriched for OPC- and NPC-like gene signatures found in human GBM. Once tumors formed, cells from each model were transplantable into C57Bl6/j mice to generate subsequent tumors. CONCLUSION We developed and validated a rapid, versatile, and reproducible system to model GBMs. These models allow for controlled study of GBM pathogenesis, progression, and treatment response, and allow for robust generation of syngeneic implantable mouse models that can serve as valuable tools for preclinical testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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