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Enregistrement W4318188920 · doi:10.1159/000529336

Epigenetic Mechanisms Governing Female and Male Germline Development in Mammals

2022· review· en· W4318188920 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueSexual Development · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermlineReprogrammingEpigenomeEpigeneticsChromatinH3K4me3DNA methylationHistoneGeneticsSomatic cellGerm cellCell biologyGenePromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: DNA methylation (DNAme) and histone posttranslational modifications (PTMs) play an integral role in the transcriptional regulation of specific sets of genes and retrotransposons. In turn, these chromatin marks are essential for cellular reprogramming, including during germline development. While DNAme is stably propagated in most somatic tissues, this epigenetic mark undergoes cycles of widespread erasure and re-establishment in the early embryo as well as in the germline. SUMMARY: De novo DNAme occurs at distinct developmental stages in male and female germ cells; before birth in prospermatogonia (PSG) and after birth in growing oocytes. Furthermore, while only ∼40% of the mouse genome is methylated in mature oocytes, ∼80% of the genome is methylated in mature sperm. Here, we review recent epigenome studies which reveal a complex interplay between histone PTMs and de novo DNAme in shaping the sexually dimorphic profiles of DNAme observed in mature gametes in the mouse, including in intergenic regions as well as at imprinted gametic differentially methylated regions (gDMRs). We discuss the dynamics and distribution of key histone PTMs in male and female germ cells, including H3K36me2/me3, H3K4me3, and H3K27me3, and the implications of positive and negative crosstalk between these PTMs and the DNAme machinery. Finally, we reflect on how the sex-specific epigenetic landscapes observed in the mouse germline impact transcriptional regulation in both the gametes and the early embryo. KEY MESSAGES: Investigation of the roles of chromatin modifying enzymes and the interplay between the chromatin marks that they deposit in germ cells has been facilitated by analyses of conventional or germline-specific knockout mice, combined with low-input genome-wide profiling methods that have been developed in recent years. While clearly informative, these findings generally reflect "snapshots" of chromatin states derived from analyses of cells analyzed in bulk at a specific period in development. Technological advances and novel experimental models will be required to further refine our understanding of the underlying mechanism and order of establishment of chromatin marks and the impact of sexually dimorphic epigenetic patterning on transcription and other nuclear processes in germ cells, the early embryo and beyond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle