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Enregistrement W4319316247 · doi:10.3390/cells12040524

Generation of Conditional Knockout Alleles for PRUNE-1

2023· article· en· W4319316247 sur OpenAlexafffund
Xiaoli Wu, Louise R. Simard, Hao Ding

Notice bibliographique

RevueCells · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Mots-clésBiologyConditional gene knockoutAlleleGeneticsNeurodegenerationLoss functionNull alleleGene knockinTransgeneGene targetingCell biologyGeneDiseasePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PRUNE1 is a member of the aspartic acid-histidine-histidine (DHH) protein superfamily, which could display an exopolyphosphatase activity and interact with multiple cellular proteins involved in the cytoskeletal rearrangement. It is widely expressed during embryonic development and is essential for embryogenesis. PRUNE1 could also be critical for postnatal development of the nervous system as it was found to be mutated in patients with microcephaly, brain malformations, and neurodegeneration. To determine the cellular function of PRUNE1 during development and in disease, we have generated conditional mouse alleles of the Prune1 in which loxP sites flank exon 6. Crossing these alleles with a ubiquitous Cre transgenic line resulted in a complete loss of PRUNE1 expression and embryonic defects identical to those previously described for Prune1 null embryos. In addition, breeding these alleles with a Purkinje cell-specific Cre line (Pcp2-Cre) resulted in the loss of Purkinje cells similar to that observed in patients carrying a mutation with loss of PRUNE1 function. Therefore, the Prune1 conditional mouse alleles generated in this study provide important genetic tools not only for dissecting the spatial and temporal roles of PRUNE1 during development but also for understanding the pathogenic role of PRUNE1 dysfunction in neurodegenerative or neurodevelopmental disease. In addition, from this work, we have described an approach that allows one to efficiently generate conditional mouse alleles based on mouse zygote electroporation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,203

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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