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Enregistrement W4319997932 · doi:10.1016/j.omtm.2023.01.003

Persistent hematopoietic polyclonality after lentivirus-mediated gene therapy for Fabry disease

2023· article· en· W4319997932 sur OpenAlexafffund
Amr H. Saleh, Michael Rothe, Dwayne L. Barber, William M. McKillop, Graeme Fraser, Chantal F. Morel, Axel Schambach, Christiane Auray‐Blais, Michael L. West, Daniel H. Fowler, C. Anthony Rupar, Ronan Foley, Jeffrey A. Medin, Armand Keating

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Methods & Clinical Development · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteJuravinski HospitalAlberta Children's HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of CalgaryHôpital FleurimontWestern UniversityUniversity of TorontoUniversité de SherbrookeMcMaster UniversityDalhousie UniversityJuravinski Cancer CentreCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalUniversity Health NetworkUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMedizinischen Hochschule HannoverKidney Foundation of CanadaMidwest Athletes Against Childhood Cancer
Mots-clésGenetic enhancementLentivirusDominance (genetics)Fabry diseaseBiologyGeneImmunologyMedicineDiseaseGeneticsInternal medicineViral diseaseVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The safety and efficacy of lentivirus-mediated gene therapy was recently demonstrated in five male patients with Fabry disease—a rare X-linked lysosomal storage disorder caused by GLA gene mutations that result in multiple end-organ complications. To evaluate the risks of clonal dominance and leukemogenesis, which have been reported in multiple gene therapy trials, we conducted a comprehensive DNA insertion site analysis of peripheral blood samples from the five patients in our gene therapy trial. We found that patients had a polyclonal integration site spectrum and did not find evidence of a dominant clone in any patient. Although we identified vector integrations near proto-oncogenes, these had low percentages of contributions to the overall pool of integrations and did not persist over time. Overall, we show that our trial of lentivirus-mediated gene therapy for Fabry disease did not lead to hematopoietic clonal dominance and likely did not elevate the risk of leukemogenic transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,138
Tête enseignante GPT0,468
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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