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Enregistrement W4362606390 · doi:10.1038/s41586-023-05874-3

Lung adenocarcinoma promotion by air pollutants

2023· article· en· W4362606390 sur OpenAlexafffund
William Hill, Emilia L. Lim, Clare E. Weeden, Claudia Lee, Marcellus Augustine, Kezhong Chen, Feng‐Che Kuan, Fabio Marongiu, Edward J. Evans, David A. Moore, Felipe Silva Rodrigues, Oriol Pich, Björn Bakker, Hongui Cha, Renelle Myers, Febe van Maldegem, Jesse Boumelha, Selvaraju Veeriah, Andrew Rowan, Cristina Naceur‐Lombardelli, Takahiro Karasaki, Monica Sivakumar, Swapnanil De, Deborah R. Caswell, A. Nagano, James R. Black, Carlos Martínez‐Ruiz, Min Hyung Ryu, Ryan D. Huff, Shijia Li, Marie-Julie Favé, Alastair Magness, Alejandro Suárez‐Bonnet, Simon L. Priestnall, Margreet Lüchtenborg, Katrina Lavelle, Joanna Pethick, Steven J. Hardy, Fiona E. McRonald, Meng‐Hung Lin, Clara I. Troccoli, Moumita Ghosh, York E. Miller, Daniel T. Merrick, Robert L. Keith, Maise Al Bakir, Chris Bailey, Mark S. Hill, Lao H. Saal, Yilun Chen, Anthony M. George, Christopher Abbosh, Nnennaya Kanu, Se‐Hoon Lee, Nicholas McGranahan, Christine D. Berg, Peter Sasieni, Richard S. Houlston, Clare Turnbull, Stephen Lam, Philip Awadalla, Eva Grönroos, Julian Downward, Tyler Jacks, Christopher Carlsten, Ilaria Malanchi, Allan Hackshaw, Kevin Litchfield, J.F. Lester, Amrita Bajaj, Apostolos Nakas, Azmina Sodha-Ramdeen, Keng Ang, Mohamad Tufail, Mohammed Fiyaz Chowdhry, Molly Scotland, Rebecca Boyles, Sridhar Rathinam, Claire Wilson, Domenic Marrone, Sean Dulloo, Dean A. Fennell, Gurdeep Matharu, Jacqui Shaw, Joan Riley, Lindsay Primrose, Ekaterini Boleti, Heather Cheyne, Mohammed S. Khalil, Shirley Richardson, Tracey Cruickshank, Gillian Price, Keith M. Kerr, Sarah Benafif, Kayleigh Gilbert, Babu Naidu, Akshay J. Patel, Aya Osman, Christer Lacson, Gerald Langman, Helen Shackleford, Madava Djearaman, Salma Kadiri, Gary Middleton, Angela Leek, Jack Davies Hodgkinson, Nicola Totten, Ángeles Montero, Elaine Smith, Eustace Fontaine, Felice Granato, Helen Doran, Juliette Novasio, Kendadai Rammohan, Leena Dennis Joseph, Rajesh Shah, Stuart Moss, Vijay Joshi, Philip Crosbie, Fábio Gomes, Kate Brown, Mathew Carter, Anshuman Chaturvedi, Lynsey Priest, Pedro Oliveira, Colin R. Lindsay, Fiona Blackhall, Matthew Krebs, Yvonne Summers, Alexandra Clipson, Jonathan Tugwood, Alastair Kerr, Dominic G. Rothwell, Elaine Kilgour, Caroline Dive, Hugo J.W.L. Aerts, Roland F. Schwarz, Tom L. Kaufmann, Gareth A. Wilson, Rachel Rosenthal, Peter Van Loo, Nicolai J. Birkbak, Zoltán Szállási, Judit Kisistók, Mateo Sokač, Roberto Salgado, Miklós Dióssy, Jonas Demeulemeester, Abigail Bunkum, Alexander M. Frankell, Angeliki Karamani, Antonia Toncheva, Ariana Huebner, Benny Chain, Brittany Campbell, Carla Castignani, Clare Puttick, Corentin Richard, Crispin T. Hiley, David R. Pearce, Despoina Karagianni, Dhruva Biswas, Dina Levi, Elena Hoxha, Elizabeth Larose Cadieux, Emma Colliver, Emma Nye, Felip Gálvez-Cancino, Foteini Athanasopoulou, Francisco Gimeno-Valiente, George Kassiotis, Georgia Stavrou, Gerasimos Mastrokalos, Hao-Ran Zhai, Helen L. Lowe, Ignacio Matos, Jacki Goldman, James L. Reading, Javier Herrero, Jayant K. Rane, Jérôme Nicod, Jie Min Lam, John A. Hartley, Karl S. Peggs, Katey S.S. Enfield, Kayalvizhi Selvaraju, Kerstin Thol, Kevin W. Ng, Krijn K. Dijkstra, Kristiana Grigoriadis, Krupa Thakkar, Leah Ensell, Mansi Shah, Marcos Vasquez Duran, Maria Litovchenko, Mariana Werner Sunderland, Michelle Dietzen, Michelle Leung, Mickael Escudero, Mihaela Angelova, Miljana Tanić, Olga Chervova, Olivia Lucas, Othman Al‐Sawaf, Paulina Prymas, Philip Hobson, Piotr Pawlik, Richard Stone, Robert B. Bentham, Robert E. Hynds, Roberto Vendramin, Sadegh Saghafinia, Saioa López, Samuel Gamble, Seng Kuong Anakin Ung, Sergio A. Quezada, Sharon Vanloo, Simone Zaccaria, Sonya Hessey, Sophia Ward, Stefan Boeing, Stephan Beck, Supreet Kaur Bola, Tamara Denner, Teresa Marafioti, Thanos P. Mourikis, Thomas B.K. Watkins, Victoria J. Spanswick, Vittorio Barbè, Wei-Ting Lu, Wing Kin Liu, Yin Wu, Yutaka Naito, Zoe Ramsden, Catarina Veiga, Gary Royle, Charles‐Antoine Collins‐Fekete, Francesco Fraioli, Paul Ashford, Tristan Clark, Martin Förster, Siow Ming Lee, Elaine Borg, Mary Falzon, Dionysis Papadatos-Pastos, James M. Wilson, Tanya Ahmad, Alexander James Procter, Asia Ahmed, Magali N. Taylor, Arjun Nair, David Lawrence, Davide Patrini, Neal Navani, Ricky M. Thakrar, Sam M. Janes, Emilie Martinoni Hoogenboom, Fleur Monk, James W. Holding, Junaid Choudhary, Kunal Bhakhri, Marco Scarci, Nikolaos Panagiotopoulos, Pat Gorman, Reena Khiroya, Robert Stephens, Yien Ning Sophia Wong, Steve Bandula, Abigail Sharp, Sean Smith, Nicole Gower, Harjot Kaur Dhanda, Kitty S. Chan, Camilla Pilotti, Rachel Leslie, Anca Grapa, Hanyun Zhang, Khalid AbdulJabbar, Xiaoxi Pan, Yinyin Yuan, David Chuter, Mairead MacKenzie, Serena Chee, Aiman Alzetani, Judith Cave, Lydia Scarlett, Jennifer Richards, Papawadee Ingram, Silvia Austin, Eric Lim, Paulo De Sousa, Simon Jordan, Alexandra Rice, Hilgardt Raubenheimer, Harshil Bhayani, Lyn Ambrose, Anand Devaraj, Hema Chavan, Sofina Begum, Silviu Buderi, Daniel Kaniu, Mpho Malima, Sarah Booth, Andrew G. Nicholson, Nadia Fernandes, Pratibha Shah, Chiara Proli, Madeleine Hewish, Sarah Danson, Michael Shackcloth, Lily Robinson, Peter Russell, Kevin G. Blyth, Craig Dick, John Le Quesne, Alan Kirk, Mo Asif, Rocco Bilancia, Nikos Kostoulas, Mathew Thomas, James DeGregori, Mariam Jamal‐Hanjani, Charles Swanton

Notice bibliographique

RevueNature · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAir Quality and Health Impacts
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchVancouver Coastal HealthVancouver Coastal Health Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesLinda Crnic Institute for Down Syndrome, University of Colorado School of Medicine, Anschutz Medical CampusNational Cancer InstituteJapan Society for the Promotion of ScienceEngineering and Physical Sciences Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeGenentechPeking University People's HospitalOno PharmaceuticalUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustChinese Academy of Medical SciencesMedical Research CouncilNational Research Foundation of KoreaCancerfondenVetenskapsrådetNational Natural Science Foundation of ChinaPeking UniversityChang Gung Medical FoundationNational Institute for Health and Care ResearchAstraZenecaInvitaeRevolution MedicinesAstex PharmaceuticalsLifeArcFrancis Crick InstituteWellcome TrustCancer Research UKUniversity College LondonStand Up To CancerMinistry of Science and ICT, South KoreaLUNGevity FoundationEntertainment Industry FoundationBristol-Myers SquibbEuropean Respiratory SocietyPfizerNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionBreast Cancer Research FoundationNational Research FoundationAmgenAmerican Association for Cancer ResearchGénome QuébecKorea Health Industry Development InstituteInternational Association for the Study of Lung CancerU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésLung cancerKRASCarcinogenesisCancer researchLungAdenocarcinomaMedicineCarcinogenCancerImmunologyOncologyBiologyInternal medicineGeneticsColorectal cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A complete understanding of how exposure to environmental substances promotes cancer formation is lacking. More than 70 years ago, tumorigenesis was proposed to occur in a two-step process: an initiating step that induces mutations in healthy cells, followed by a promoter step that triggers cancer development1. Here we propose that environmental particulate matter measuring ≤2.5 μm (PM2.5), known to be associated with lung cancer risk, promotes lung cancer by acting on cells that harbour pre-existing oncogenic mutations in healthy lung tissue. Focusing on EGFR-driven lung cancer, which is more common in never-smokers or light smokers, we found a significant association between PM2.5 levels and the incidence of lung cancer for 32,957 EGFR-driven lung cancer cases in four within-country cohorts. Functional mouse models revealed that air pollutants cause an influx of macrophages into the lung and release of interleukin-1β. This process results in a progenitor-like cell state within EGFR mutant lung alveolar type II epithelial cells that fuels tumorigenesis. Ultradeep mutational profiling of histologically normal lung tissue from 295 individuals across 3 clinical cohorts revealed oncogenic EGFR and KRAS driver mutations in 18% and 53% of healthy tissue samples, respectively. These findings collectively support a tumour-promoting role for PM2.5 air pollutants and provide impetus for public health policy initiatives to address air pollution to reduce disease burden. Combination of epidemiology, preclinical models and ultradeep DNA profiling of clinical cohorts unpicks the inflammatory mechanism by which air pollution promotes lung cancer

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations761
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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