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Enregistrement W4365143915 · doi:10.1038/s41591-023-02232-8

Body composition and lung cancer-associated cachexia in TRACERx

2023· article· en· W4365143915 sur OpenAlexaff
Othman Al‐Sawaf, Jakob Weiss, Marcin Skrzypski, Jie Min Lam, Takahiro Karasaki, Francisco Zambrana, Andrew Kidd, Alexander M. Frankell, Thomas B.K. Watkins, Carlos Martínez‐Ruiz, Clare Puttick, James R. Black, Ariana Huebner, Maise Al Bakir, Mateo Sokač, Susie M. Collins, Selvaraju Veeriah, Neil Magno, Cristina Naceur‐Lombardelli, Paulina Prymas, Antonia Toncheva, Sophia Ward, Nick Jayanth, Roberto Salgado, Christopher P. Bridge, David C. Christiani, Raymond H. Mak, Camden Bay, Michael H. Rosenthal, Naveed Sattar, Paul Welsh, Ying Liu, Norbert Perrimon, Karteek Popuri, Mirza Faisal Beg, Nicholas McGranahan, Allan Hackshaw, Danna M. Breen, Stephen O’Rahilly, Nicolai J. Birkbak, Hugo J.W.L. Aerts, J.F. Lester, Amrita Bajaj, Apostolos Nakas, Azmina Sodha-Ramdeen, Keng Ang, Mohamad Tufail, Mohammed Fiyaz Chowdhry, Molly Scotland, Rebecca Boyles, Sridhar Rathinam, Claire Wilson, Domenic Marrone, Sean Dulloo, Dean A. Fennell, Gurdeep Matharu, Jacqui Shaw, Joan Riley, Lindsay Primrose, Ekaterini Boleti, Heather Cheyne, Mohammed Khalil, Shirley Richardson, Tracey Cruickshank, Gillian Price, Keith M. Kerr, Sarah Benafif, Kayleigh Gilbert, Babu Naidu, Akshay J. Patel, Aya Osman, Christer Lacson, Gerald Langman, Helen Shackleford, Madava Djearaman, Salma Kadiri, Gary Middleton, Angela Leek, Jack Davies Hodgkinson, Nicola Totten, Ángeles Montero, Elaine Smith, Eustace Fontaine, Felice Granato, Helen Doran, Juliette Novasio, Kendadai Rammohan, Leena Dennis Joseph, Rajesh Shah, Stuart Moss, Vijay Joshi, Philip Crosbie, Fábio Gomes, Kate Brown, Mathew Carter, Anshuman Chaturvedi, Lynsey Priest, Pedro Oliveira, Colin R. Lindsay, Fiona Blackhall, Matthew Krebs, Yvonne Summers, Alexandra Clipson, Jonathan Tugwood, Alastair Kerr, Dominic G. Rothwell, Elaine Kilgour, Caroline Dive, Roland F. Schwarz, Tom L. Kaufmann, Gareth A. Wilson, Rachel Rosenthal, Peter Van Loo, Zoltán Szállási, Judit Kisistók, Miklós Dióssy, Jonas Demeulemeester, Abigail Bunkum, Alastair Magness, Andrew Rowan, Angeliki Karamani, Benny Chain, Brittany Campbell, Carla Castignani, Chris Bailey, Christopher Abbosh, Clare E. Weeden, Claudia Lee, Corentin Richard, Crispin T. Hiley, David A. Moore, David R. Pearce, Despoina Karagianni, Dhruva Biswas, Dina Levi, Elena Hoxha, Elizabeth Larose Cadieux, Emilia L. Lim, Emma Colliver, Emma Nye, Eva Grönroos, Felip Gálvez-Cancino, Foteini Athanasopoulou, Francisco Gimeno-Valiente, George Kassiotis, Georgia Stavrou, Gerasimos Mastrokalos, Hao-Ran Zhai, Helen L. Lowe, Ignacio Matos, Jacki Goldman, James L. Reading, Javier Herrero, Jayant K. Rane, Jérôme Nicod, John A. Hartley, Karl S. Peggs, Katey S.S. Enfield, Kayalvizhi Selvaraju, Kerstin Thol, Kevin Litchfield, Kevin W. Ng, Kezhong Chen, Krijn K. Dijkstra, Kristiana Grigoriadis, Krupa Thakkar, Leah Ensell, Mansi Shah, Marcos Vasquez Duran, Maria Litovchenko, Mariana Werner Sunderland, Mark S. Hill, Michelle Dietzen, Michelle Leung, Mickael Escudero, Mihaela Angelova, Miljana Tanić, Monica Sivakumar, Nnennaya Kanu, Olga Chervova, Olivia Lucas, Oriol Pich, Philip Hobson, Piotr Pawlik, Richard Stone, Robert B. Bentham, Robert E. Hynds, Roberto Vendramin, Sadegh Saghafinia, Saioa López, Samuel Gamble, Seng Kuong Anakin Ung, Sergio A. Quezada, Sharon Vanloo, Simone Zaccaria, Sonya Hessey, Stefan Boeing, Stephan Beck, Supreet Kaur Bola, Tamara Denner, Teresa Marafioti, Thanos P. Mourikis, Victoria J. Spanswick, Vittorio Barbè, Wei-Ting Lu, William Hill, Wing Kin Liu, Yin Wu, Yutaka Naito, Zoe Ramsden, Catarina Veiga, Gary Royle, Charles‐Antoine Collins‐Fekete, Francesco Fraioli, Paul Ashford, Tristan Clark, Martin Förster, Siow Ming Lee, Elaine Borg, Mary Falzon, Dionysis Papadatos-Pastos, James M. Wilson, Tanya Ahmad, Alexander James Procter, Asia Ahmed, Magali N. Taylor, Arjun Nair, David Lawrence, Davide Patrini, Neal Navani, Ricky M. Thakrar, Sam M. Janes, Emilie Martinoni Hoogenboom, Fleur Monk, James W. Holding, Junaid Choudhary, Kunal Bhakhri, Marco Scarci, Nikolaos Panagiotopoulos, Pat Gorman, Reena Khiroya, Robert Stephens, Yien Ning Sophia Wong, Steve Bandula, Abigail Sharp, Sean Smith, Nicole Gower, Harjot Kaur Dhanda, Kitty S. Chan, Camilla Pilotti, Rachel Leslie, Anca Grapa, Hanyun Zhang, Khalid AbdulJabbar, Xiaoxi Pan, Yinyin Yuan, David Chuter, Mairead MacKenzie, Serena Chee, Aiman Alzetani, Judith Cave, Lydia Scarlett, Jennifer Richards, Papawadee Ingram, Silvia Austin, Eric Lim, Paulo De Sousa, Simon Jordan, Alexandra Rice, Hilgardt Raubenheimer, Harshil Bhayani, Lyn Ambrose, Anand Devaraj, Hema Chavan, Sofina Begum, Silviu Buderi, Daniel Kaniu, Mpho Malima, Sarah Booth, Andrew G. Nicholson, Nadia Fernandes, Pratibha Shah, Chiara Proli, Madeleine Hewish, Sarah Danson, Michael Shackcloth, Lily Robinson, Peter Russell, Kevin G. Blyth, Craig Dick, John Le Quesne, Mo Asif, Rocco Bilancia, Nikos Kostoulas, Mathew Thomas, Mariam Jamal‐Hanjani, Charles Swanton

Notice bibliographique

RevueNature Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNutrition and Health in Aging
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesFP7 People: Marie-Curie ActionsMedical Research CouncilPfizer UKGenentechGdański Uniwersytet MedycznyNovo Nordisk FondenUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustNIHR Cambridge Biomedical Research CentrePeter MacCallum Cancer CentreStand Up To CancerNovo NordiskDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of GlasgowNational Institutes of HealthRosetrees TrustUniversity College LondonWellcome TrustCancer Research UKFoulkes FoundationFrancis Crick InstituteInstitut for Klinisk Medicin, Aarhus UniversitetInternational Association for the Study of Lung CancerBeiGeneNational Institute for Health and Care ResearchAarhus UniversitetshospitalNational Cancer InstituteGilead SciencesBrigham and Women's HospitalEuropean CommissionAarhus UniversitetBreast Cancer Research FoundationSanofiMassachusetts General HospitalGlaxoSmithKlineBristol-Myers SquibbOno PharmaceuticalLundbeckfondenEli Lilly and CompanyAstraZenecaAmgenPfizer
Mots-clésCancer cachexiaCachexiaLung cancerMedicineComposition (language)CancerBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer-associated cachexia (CAC) is a major contributor to morbidity and mortality in individuals with non-small cell lung cancer. Key features of CAC include alterations in body composition and body weight. Here, we explore the association between body composition and body weight with survival and delineate potential biological processes and mediators that contribute to the development of CAC. Computed tomography-based body composition analysis of 651 individuals in the TRACERx (TRAcking non-small cell lung Cancer Evolution through therapy (Rx)) study suggested that individuals in the bottom 20th percentile of the distribution of skeletal muscle or adipose tissue area at the time of lung cancer diagnosis, had significantly shorter lung cancer-specific survival and overall survival. This finding was validated in 420 individuals in the independent Boston Lung Cancer Study. Individuals classified as having developed CAC according to one or more features at relapse encompassing loss of adipose or muscle tissue, or body mass index-adjusted weight loss were found to have distinct tumor genomic and transcriptomic profiles compared with individuals who did not develop such features. Primary non-small cell lung cancers from individuals who developed CAC were characterized by enrichment of inflammatory signaling and epithelial-mesenchymal transitional pathways, and differentially expressed genes upregulated in these tumors included cancer-testis antigen MAGEA6 and matrix metalloproteinases, such as ADAMTS3. In an exploratory proteomic analysis of circulating putative mediators of cachexia performed in a subset of 110 individuals from TRACERx, a significant association between circulating GDF15 and loss of body weight, skeletal muscle and adipose tissue was identified at relapse, supporting the potential therapeutic relevance of targeting GDF15 in the management of CAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,397
Score d'incertitude au seuil0,376

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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