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Enregistrement W4366550103 · doi:10.1101/2023.04.19.537542

Tracking insulin- and glucagon-expressing bihormonal cells during differentiation using an <i>INSULIN</i> and <i>GLUCAGON</i> double reporter human embryonic stem cell line

2023· preprint· en· W4366550103 sur OpenAlexafffund
Samantha Mar, Ekaterina Filatov, Cuilan Nian, Shugo Sasaki, Dahai Zhang, Francis C. Lynn

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCUniversity of AlbertaBC Children's Hospital
Mots-clésGlucagonInsulinEmbryonic stem cellCell biologyBiologyGreen fluorescent proteinCell cultureStem cellBeta cellAlpha cellCellular differentiationReporter geneEnteroendocrine cellEndocrinologyInternal medicineHormoneGene expressionEndocrine systemIsletGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Human embryonic stem cell (hESC)-derived pancreatic alpha and beta cells can be used to develop cell replacement therapies to treat diabetes. However, recent published differentiation protocols yield varying amounts of alpha and beta cells amidst heterogeneous cell populations. To visualize and isolate hESC-derived alpha and beta cells, we generated a GLUCAGON-2A- mScarlet and INSULIN-2A-EGFP dual fluorescent reporter (INS EGFP GCG mScarlet ) hESC line using CRISPR/Cas9. We established robust expression of EGFP and mScarlet fluorescent proteins in insulin- and glucagon-expressing cells respectively without compromising the differentiation or function of these cells. We also showed the insulin- and glucagon-expressing bihormonal population at the maturing endocrine cell stage (Stage 6) lose insulin expression over time, while maintaining an alpha-like expression profile, suggesting these bihormonal cells are preferentially fated to become alpha-like cells in vitro . Together, the INS EGFP GCG mScarlet hESC line provides an efficient strategy for tracking populations of hESC-derived beta- and alpha-like cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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