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Enregistrement W4381597738 · doi:10.1084/jem.20230661

Autoantibodies neutralizing type I IFNs underlie West Nile virus encephalitis in ∼40% of patients

2023· article· en· W4381597738 sur OpenAlexfundno aff
Adrian Gervais, Francesca Rovida, Maria Antonietta Avanzini, Stefania Croce, Astrid Marchal, Shih‐Ching Lin, Alessandro Ferrari, Christian W. Thorball, Orianne Constant, Tom Le Voyer, Quentin Philippot, Jérémie Rosain, Micol Angelini, Malena Pérez Lorenzo, Lucy Bizien, Cristian Achille, Francesca Trespidi, Elisa Burdino, Irene Cassaniti, Daniele Lilleri, Chiara Fornara, Josè Camilla Sammartino, Danilo Cereda, Chiara Marrocu, Antonio Piralla, Chiara Valsecchi, Stéfano Ricagno, Paola Cogo, Olaf Neth, Inés Marín‐Cruz, Monia Pacenti, Alessandro Sinigaglia, Marta Trevisan, Andrea Volpe, Antonio Marzollo, Francesca Conti, Tiziana Lazzarotto, Andrea Pession, Pierluigi Viale, Jacques Fellay, Stefano Ghirardello, Mélodie Aubart, Valeria Ghisetti, Alessandro Aiuti, Emmanuelle Jouanguy, Paul Bastard, Elena Percivalle, Fausto Baldanti, Anne Puel, Margaret R. MacDonald, Charles M. Rice, Giada Rossini, Kristy O. Murray, Yannick Simonin, Anna Nagy, Luisa Barzon, Laurent Abel, Michael S. Diamond, Aurélie Cobat, Shen‐Ying Zhang, Jean‐Laurent Casanova, A. Borghesi

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of HealthMinistero della DifesaFondation Bettencourt SchuellerMinistero della SaluteMinistère de l'Education Nationale, de l'Enseignement Superieur et de la RechercheEuropean Society for ImmunodeficienciesHospital for Sick ChildrenNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesFisher Center for Alzheimer's Research FoundationAgence Nationale de la RechercheUniversità degli Studi di PaviaAssistance Publique - Hôpitaux de ParisEuropean CommissionSCOR Corporate Foundation for ScienceInstitut des maladies génétiques ImagineMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'InnovationAssistance publique-Hôpitaux de ParisMeyer FoundationRockefeller UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFondation du SouffleHorizon 2020 Framework ProgrammeOpen Square FoundationFondation pour la Recherche MédicaleJPB FoundationGeorgia Clinical and Translational Science AllianceHoward Hughes Medical InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFondazione IRCCS Policlinico San MatteoUniversità degli Studi di PadovaSt. Giles Foundation
Mots-clésEncephalitisVirologyNeutralizing antibodyJapanese encephalitisAntibodyPopulationVero cellMedicineFlavivirusAutoantibodyImmunologyTiterVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mosquito-borne West Nile virus (WNV) infection is benign in most individuals but can cause encephalitis in <1% of infected individuals. We show that ∼35% of patients hospitalized for WNV disease (WNVD) in six independent cohorts from the EU and USA carry auto-Abs neutralizing IFN-α and/or -ω. The prevalence of these antibodies is highest in patients with encephalitis (∼40%), and that in individuals with silent WNV infection is as low as that in the general population. The odds ratios for WNVD in individuals with these auto-Abs relative to those without them in the general population range from 19.0 (95% CI 15.0-24.0, P value <10-15) for auto-Abs neutralizing only 100 pg/ml IFN-α and/or IFN-ω to 127.4 (CI 87.1-186.4, P value <10-15) for auto-Abs neutralizing both IFN-α and IFN-ω at a concentration of 10 ng/ml. These antibodies block the protective effect of IFN-α in Vero cells infected with WNV in vitro. Auto-Abs neutralizing IFN-α and/or IFN-ω underlie ∼40% of cases of WNV encephalitis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations115
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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