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Enregistrement W4385686612 · doi:10.4049/jimmunol.210.supp.155.07

Trisomy 8-associated Autoinflammatory Disease (TRIAD) is Characterized by Dysregulated Myeloid Cells

2023· article· en· W4385686612 sur OpenAlexaff
Kalpana Manthiram, Qin Xu, Zhijie Wu, Mary Bowes, Shouguo Gao, Cihan Oguz, Abdel G. Elkahloun, Shelley S. Kalsi, Alina Dulau‐Florea, Tina Romeo, Lihong Shi, Thomas Cassini, Natalie Deuitch, Martha Kirby, Stacie M. Anderson, Deborah A. Bruns, Amanda K. Ombrello, Karyl S. Barron, Elaine F. Remmers, Frank X. Donovan, William Peterson, Jill Cochran, Ronald M. Laxer, Jessica Greenberg, Wadih M. Zein, Brian P. Brooks, Sandro Félix Perazzio, Isabelle Koné‐Paut, Nora Al-Mutiari, Valtýr Thors, Johanna Guðrún Pálmadóttir, Florence A. Aeschlimann, Pierre Quartier, Karen Murphy, Settara Chandrasekarappa, Troy R. Torgerson, Pamela L. Schwartzberg, Daniel L. Kastner

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunologyMyeloidTrisomy 8BiologyTrisomyBone marrowKaryotypeGeneticsChromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Trisomy 8 mosaicism (T8M) has been associated with a Behçet’s-like inflammatory disease, but immunologic features and treatment responses are not well-characterized. Here, we characterize 20 individuals with constitutional T8M and inflammatory disease. Most participants had congenital dysmorphologies and developmental delay. Two developed hematologic malignancies, two had bleeding diathesis due to platelet dense granule deficiency, and most had macrocytosis. The majority had recurrent fever and severe oral ulcerations, while nearly half had genital ulcers or rash. Colchicine, apremilast, and IL-1 and TNFa inhibitors were effective therapies. With ddPCR on sorted cell populations, we found that cells from the myeloid lineage (monocytes, neutrophils, megakaryocytes, erythroid progenitors) had a significantly higher percentage of trisomy 8 mosaicism compared to those from the lymphoid lineage (T and B cells) in both the peripheral blood and bone marrow, suggesting that trisomy 8 is tolerated to a greater degree by myeloid cells. Furthermore, we found that participants with T8M had more classical monocytes and had upregulation of genes associated with activated neutrophils and monocytes in their whole blood compared to healthy controls. With single cell RNAseq, we identifed which cells were trisomy 8 and disomy based on chromosome 8 gene expression and found that trisomy 8 monocytes had distinct transcriptional signatures and alteration of innate immune genes. Our findings suggest that patients with T8M are prone to a distinct autoinflammatory disease which we propose calling trisomy 8 associated autoinflammatory disease (TRIAD) and have complications due to dysregulation of cells arising from the myeloid lineage. This work was supported by the Intramural Research Program of NIAID, NHGRI, and NHLBI, NIH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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