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Enregistrement W4386088828 · doi:10.1126/sciadv.adg6693

A MYCN-independent mechanism mediating secretome reprogramming and metastasis in <i>MYCN</i> -amplified neuroblastoma

2023· article· en· W4386088828 sur OpenAlexafffund
Hai‐Feng Zhang, Alberto Delaidelli, Sumreen Javed, Busra Turgu, Taylor Morrison, Christopher S. Hughes, Xiaqiu Yang, Manideep C. Pachva, Michael M. Lizardo, Gurdeep Singh, Jennifer Hoffmann, Yue Z. Huang, Khushbu Patel, Rawan Shraim, Sonia H.Y. Kung, Gregg B. Morin, Samuel Aparício, Daniel Martínez, John M. Maris, Kristopher R. Bosse, Karla C. Williams, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesStand Up To CancerNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBC Cancer FoundationMichael Smith Health Research BCLotte and John Hecht Memorial FoundationCanadian Institutes of Health ResearchAlex's Lemonade Stand Foundation for Childhood CancerDamon Runyon Cancer Research FoundationAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésNeuroblastomaMechanism (biology)ReprogrammingMetastasisCancer researchBiologyGeneticsCancerGeneCell culturePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MYCN amplification ( MNA ) is a defining feature of high-risk neuroblastoma (NB) and predicts poor prognosis. However, whether genes within or in close proximity to the MYCN amplicon also contribute to MNA + NB remains poorly understood. Here, we identify that GREB1 , a transcription factor encoding gene neighboring the MYCN locus, is frequently coexpressed with MYCN and promotes cell survival in MNA + NB. GREB1 controls gene expression independently of MYCN, among which we uncover myosin 1B ( MYO1B ) as being highly expressed in MNA + NB and, using a chick chorioallantoic membrane (CAM) model, as a crucial regulator of invasion and metastasis. Global secretome and proteome profiling further delineates MYO1B in regulating secretome reprogramming in MNA + NB cells, and the cytokine MIF as an important pro-invasive and pro-metastatic mediator of MYO1B activity. Together, we have identified a putative GREB1-MYO1B-MIF axis as an unconventional mechanism promoting aggressive behavior in MNA + NB and independently of MYCN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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