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Enregistrement W4387728795 · doi:10.1176/appi.ajp.20230053

Meta-Analyses of Genome-Wide Association Studies for Postpartum Depression

2023· article· en· W4387728795 sur OpenAlexfundno aff
Jerry Guintivano, Enda M. Byrne, Jacqueline Kiewa, Shuyang Yao, Anna E. Bauer, Karolina A. Åberg, Mark J. Adams, Archie Campbell, Megan L. Campbell, Karmel W. Choi, Elizabeth C. Corfield, Alexandra Havdahl, Donald Hucks, Nastassja Koen, Yi Lu, Merete Lund Mægbæk, Jimmy Mullaert, Roseann E. Peterson, Laura M. Raffield, Hannah Sallis, Julia Sealock, Alicia Walker, Hunna J. Watson, Ying Xiong, Jessica Yang, Richard Anney, Katherine Gordon‐Smith, Leon Hubbard, Lisa Jones, Raluca Mihăescu, Mette Nyegaard, Antonio F. Pardiñas, Amy Perry, Nazmus Saquib, Aladdin H. Shadyab, Alexander Viktorin, Ole A. Andreassen, Tim B. Bigdeli, Lea K. Davis, Cindy‐Lee Dennis, Arianna Di Florio, Caroline Dubertret, Yen‐Chen Anne Feng, Benício N. Frey, Sophie Grigoriadis, Emilie Gloaguen, Ian Jones, James L. Kennedy, Holly Krohn, Theodora Kunovac Kallak, Yun Li, Nicholas G. Martin, Andrew M. McIntosh, Jeannette Milgrom, Trine Munk‐Olsen, Tim F. Oberlander, Catherine M. Olsen, Nicolás Ramoz, Ted Reichborn‐Kjennerud, Emma Robertson Blackmore, David Rubinow, Alkistis Skalkidou, Jordan W. Smoller, Dan J. Stein, Zachary N. Stowe, Valerie H. Taylor, Sarah Tebeka, Martin Tesli, Ryan J. Van Lieshout, Edwin J. C. G. van den Oord, Simone N. Vigod, Thomas Werge, Lars T. Westlye, David C. Whiteman, Heather J. Zar, Naomi R. Wray, Samantha Meltzer‐Brody, Patrick Sullivan

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Psychiatry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeNorges ForskningsrådH. Lundbeck A/SNational Institute of Mental HealthVetenskapsrådetLundbeckfondenWellcome TrustNational Institutes of HealthSage TherapeuticsNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionHelse Sør-Øst RHFMedical Research CouncilBiogenWomen's College HospitalEuropean CommissionBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésDepression (economics)Genome-wide association studyPostpartum depressionAssociation (psychology)Genetic associationPsychologyPsychiatryMeta-analysisMedicineClinical psychologyGeneticsBiologyPregnancyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismPsychotherapistGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Postpartum depression (PPD) is a common subtype of major depressive disorder (MDD) that is more heritable, yet is understudied in psychiatric genetics. The authors conducted meta-analyses of genome-wide association studies (GWASs) to investigate the genetic architecture of PPD. METHOD: Meta-analyses were conducted on 18 cohorts of European ancestry (17,339 PPD cases and 53,426 controls), one cohort of East Asian ancestry (975 cases and 3,780 controls), and one cohort of African ancestry (456 cases and 1,255 controls), totaling 18,770 PPD cases and 58,461 controls. Post-GWAS analyses included 1) single-nucleotide polymorphism (SNP)-based heritability ([Formula: see text]), 2) genetic correlations between PPD and other phenotypes, and 3) enrichment of the PPD GWAS findings in 27 human tissues and 265 cell types from the mouse central and peripheral nervous system. RESULTS: No SNP achieved genome-wide significance in the European or the trans-ancestry meta-analyses. The [Formula: see text] of PPD was 0.14 (SE=0.02). Significant genetic correlations were estimated for PPD with MDD, bipolar disorder, anxiety disorders, posttraumatic stress disorder, insomnia, age at menarche, and polycystic ovary syndrome. Cell-type enrichment analyses implicate inhibitory neurons in the thalamus and cholinergic neurons within septal nuclei of the hypothalamus, a pattern that differs from MDD. CONCLUSIONS: While more samples are needed to reach genome-wide levels of significance, the results presented confirm PPD as a polygenic and heritable phenotype. There is also evidence that despite a high correlation with MDD, PPD may have unique genetic components. Cell enrichment results suggest GABAergic neurons, which converge on a common mechanism with the only medication approved by the U.S. Food and Drug Administration for PPD (brexanolone).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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