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Enregistrement W4388824157 · doi:10.1038/s41588-023-01563-z

Multi-ancestry genome-wide association study of cannabis use disorder yields insight into disease biology and public health implications

2023· article· en· W4388824157 sur OpenAlexaff
Daniel F. Levey, Marco Galimberti, Joseph D. Deak, Frank R. Wendt, Arjun Bhattacharya, Dóra Koller, Kelly Harrington, Rachel Quaden, Emma C. Johnson, Priya Gupta, Mahantesh I. Biradar, Max Lam, Megan E. Cooke, Veera M. Rajagopal, Stefany Lucas Lopes Empke, Hang Zhou, Yaira Z. Nuñez, Henry R. Kranzler, Howard J. Edenberg, Arpana Agrawal, Jordan W. Smoller, Todd Lencz, David M. Hougaard, Anders D. Børglum, Ditte Demontis, J. Michael Gaziano, Michael J. Gandal, Renato Polimanti, Murray B. Stein, Joel Gelernter

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Mental HealthNational Center for PTSD, U.S. Department of Veterans AffairsNational Institutes of HealthFoundation for the National Institutes of HealthNovo Nordisk FondenLundbeckfondenAarhus UniversitetEuropean CommissionNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismOne MindNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Institute on Drug AbuseNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionNovo NordiskVISN 4 Mental Illness Research, Education, and Clinical CenterOffice of Research and DevelopmentNIH Clinical CenterH. Lundbeck A/SU.S. Department of Veterans AffairsBrain and Behavior Research Foundation
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyDiseaseCannabisGeneticsGenetic associationGenomePublic healthAssociation (psychology)Computational biologyEvolutionary biologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGenePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract As recreational use of cannabis is being decriminalized in many places and medical use widely sanctioned, there are growing concerns about increases in cannabis use disorder (CanUD), which is associated with numerous medical comorbidities. Here we performed a genome-wide association study of CanUD in the Million Veteran Program (MVP), followed by meta-analysis in 1,054,365 individuals ( n cases = 64,314) from four broad ancestries designated by the reference panel used for assignment (European n = 886,025, African n = 123,208, admixed American n = 38,289 and East Asian n = 6,843). Population-specific methods were applied to calculate single nucleotide polymorphism-based heritability within each ancestry. Statistically significant single nucleotide polymorphism-based heritability for CanUD was observed in all but the smallest population (East Asian). We discovered genome-wide significant loci unique to each ancestry: 22 in European, 2 each in African and East Asian, and 1 in admixed American ancestries. A genetically informed causal relationship analysis indicated a possible effect of genetic liability for CanUD on lung cancer risk, suggesting potential unanticipated future medical and psychiatric public health consequences that require further study to disentangle from other known risk factors such as cigarette smoking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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