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Enregistrement W4390350774 · doi:10.1016/j.cell.2023.11.036

Human inherited CCR2 deficiency underlies progressive polycystic lung disease

2023· article· en· W4390350774 sur OpenAlexafffund
Anna‐Lena Neehus, Brenna Carey, Marija Landekic, Patricia Panikulam, Gail Deutsch, Masato Ogishi, Carlos A. Arango-Franco, Quentin Philippot, Mohammadreza Modaresi, Iraj Mohammadzadeh, Melissa Corcini Berndt, Darawan Rinchai, Tom Le Voyer, Jérémie Rosain, Mana Momenilandi, Marta Martín-Fernández, Taushif Khan, Jonathan Bohlen, Ji Eun Han, Alexandre Deslys, Mathilde Bernard, Tania Gajardo-Carrasco, Camille Soudée, Corentin Le Floc’h, Mélanie Migaud, Yoann Seeleuthner, Mi-Sun Jang, Eirini Nikolouli, Simin Seyedpour, Hugues Bégueret, Jean‐François Emile, Pierre Le Guen, Guido Tavazzi, Costanza Natalia Julia Colombo, Federico Capra Marzani, Micol Angelini, Francesca Trespidi, Stefano Ghirardello, Nasrin Alipour, Anne Molitor, Raphaël Carapito, Mohsen Mazloomrezaei, Hassan Rokni‐Zadeh, Majid Changi‐Ashtiani, Chantal Brouzes, Pablo Vargas, A. Borghesi, Nico Lachmann, Seiamak Bahram, Bruno Crestani, Michaël Fayon, François Galodé, Susanta Pahari, Larry S. Schlesinger, Nico Marr, Dusan Bogunovic, Stéphanie Boisson‐Dupuis, Vivien Béziat, Laurent Abel, Raphaël Borie, Lisa R. Young, Robin Deterding, Mohammad Shahrooei, Nima Rezaei, Nima Parvaneh, Daniel Craven, Philippe Gros, Danielle Malo, Fernando E. Sepulveda, Lawrence M. Nogee, Nathalie Aladjidi, B.C. Trapnell, Jean-Laurent Casanova, Jacinta Bustamante

Notice bibliographique

RevueCell · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteInstituto Nacional del CáncerNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de ParisHonjo International Scholarship FoundationAgence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites ViralesAssistance Publique - Hôpitaux de ParisDivision of Agriculture and Natural Resources, University of CaliforniaUniversité de StrasbourgInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleInstitut des maladies génétiques ImagineDeutsche ForschungsgemeinschaftVaccine Research CenterTexas Biomedical Research InstituteFondation pour la Recherche MédicaleRockefeller UniversityEuropean Molecular Biology OrganizationSt. Giles FoundationAmerican Thoracic SocietyCentre National de la Recherche ScientifiqueFondation Bettencourt SchuellerNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAgence Nationale de la RechercheHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyDiseaseLungLung diseaseGeneticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe a human lung disease caused by autosomal recessive, complete deficiency of the monocyte chemokine receptor C-C motif chemokine receptor 2 (CCR2). Nine children from five independent kindreds have pulmonary alveolar proteinosis (PAP), progressive polycystic lung disease, and recurrent infections, including bacillus Calmette Guérin (BCG) disease. The CCR2 variants are homozygous in six patients and compound heterozygous in three, and all are loss-of-expression and loss-of-function. They abolish CCR2-agonist chemokine C-C motif ligand 2 (CCL-2)-stimulated Ca 2+ signaling in and migration of monocytic cells. All patients have high blood CCL-2 levels, providing a diagnostic test for screening children with unexplained lung or mycobacterial disease. Blood myeloid and lymphoid subsets and interferon (IFN)-γ- and granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF)-mediated immunity are unaffected. CCR2-deficient monocytes and alveolar macrophage-like cells have normal gene expression profiles and functions. By contrast, alveolar macrophage counts are about half. Human complete CCR2 deficiency is a genetic etiology of PAP, polycystic lung disease, and recurrent infections caused by impaired CCL2-dependent monocyte migration to the lungs and infected tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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