MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392582100 · doi:10.1101/2024.03.06.24303776

Genome-wide association study identifies new loci associated with OCD

2024· preprint· en· W4392582100 sur OpenAlexafffund
Nora I. Strom, Matthew Halvorsen, Chao Tian, Christian Rück, Gerd Kvale, Bjarne Hansen, Jonas Bybjerg‐Grauholm, Jakob Grove, Julia Boberg, Judith Becker Nissen, Thomas D. Als, Thomas Werge, Elles de Schipper, Bengt T. Fundín, Christina M. Hultman, Kira D. Höffler, Nancy L. Pedersen, Sven Sandin, Cynthia M. Bulik, Mikael Landén, Elinor K. Karlsson, Kristen Hagen, Kerstin Lindblad‐Toh, David M. Hougaard, Sandra Meier, Stéphanie Le Hellard, Ole Mors, Anders D. Børglum, Jan Haavik, David A. Hinds, David Mataix‐Cols, James J. Crowley, Manuel Mattheisen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthInstituto Nacional de Medicina GenómicaFundació Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d’HebronNorwegian Institute of Public HealthHaukeland UniversitetssjukehusRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnTartu ÜlikoolH. Lundbeck A/SDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenUniversitetet i BergenFudan UniversityAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgUniversity of New South WalesInstituto de Salud Carlos IIIUniversitat de BarcelonaGöteborgs UniversitetKoninklijke Nederlandse Akademie van WetenschappenRijksuniversiteit GroningenKarolinska InstitutetLundbeckfondenInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDepartment of Psychiatry, Columbia UniversityJohns Hopkins Bloomberg School of Public HealthVanderbilt UniversityUniversitetet i OsloAmsterdam University Medical CentersNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetNational Institute of Mental HealthAarhus UniversitetBroad InstituteUniversität zu KölnDalhousie UniversityNational Health Research InstitutesVanderbilt University Medical CenterUniversity of PittsburghUniversity of SydneyJohns Hopkins UniversityUniversity of North Carolina at Chapel HillUniversiteit StellenboschHelsingin YliopistoBrown UniversityGeorg-August-Universität GöttingenAssistance publique-Hôpitaux de ParisMassachusetts General Hospital
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismHeritabilityGenetic associationSNPBiologyGeneticsMissing heritability problemGenetic architectureGeneQuantitative trait locusGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To date, four genome-wide association studies (GWAS) of obsessive-compulsive disorder (OCD) have been published, reporting a high single-nucleotide polymorphism (SNP)-heritability of 28% but finding only one significant SNP. A substantial increase in sample size will likely lead to further identification of SNPs, genes, and biological pathways mediating the susceptibility to OCD. We conducted a GWAS meta-analysis with a 2-3-fold increase in case sample size (OCD cases: N = 37,015, controls: N = 948,616) compared to the last OCD GWAS, including six previously published cohorts (OCGAS, IOCDF-GC, IOCDF-GC-trio, NORDiC-nor, NORDiC-swe, and iPSYCH) and unpublished self-report data from 23andMe Inc. We explored the genetic architecture of OCD by conducting gene-based tests, tissue and celltype enrichment analyses, and estimating heritability and genetic correlations with 74 phenotypes. To examine a potential heterogeneity in our data, we conducted multivariable GWASs with MTAG. We found support for 15 independent genome-wide significant loci (14 new) and 79 protein-coding genes. Tissue enrichment analyses implicate multiple cortical regions, the amygdala, and hypothalamus, while cell type analyses yielded 12 cell types linked to OCD (all neurons). The SNP-based heritability of OCD was estimated to be 0.08. Using MTAG we found evidence for specific genetic underpinnings characteristic of different cohort-ascertainment and identified additional significant SNPs. OCD was genetically correlated with 40 disorders or traits-positively with all psychiatric disorders and negatively with BMI, age at first birth and multiple autoimmune diseases. The GWAS meta-analysis identified several biologically informative genes as important contributors to the aetiology of OCD. Overall, we have begun laying the groundwork through which the biology of OCD will be understood and described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetObsessive-Compulsive Spectrum DisordersTravaux en français237 207