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Enregistrement W4400105048 · doi:10.1021/acs.jnatprod.3c01234

Discovery of the Lipopeptides Albubactins A–H from <i>Streptomyces albidoflavus</i> RKJM0023 via Chemical Elicitation with Rhamnolipids and Synthesis of Albubactin A

2024· article· en· W4400105048 sur OpenAlexafffund
Zacharie A. Maw, Alyssa L. Grunwald, Bradley Haltli, Christopher Cartmell, Russell G. Kerr

Notice bibliographique

RevueJournal of Natural Products · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensNautilus Biosciences (Canada)University of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for InnovationFondation Jean-Louis Lévesque
Mots-clésStreptomycetaceaeStreptomycesChemical synthesisChemistryActinomycetalesStereochemistryOrganic chemistryBacteriaBiochemistryMicrobiologyCombinatorial chemistryBiologyIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The marine tunicate-derived Streptomyces albidoflavus RKJM0023 was cultured in the presence of a rhamnolipid mixture in an effort to elicit the production of silent natural products. MS/MS-based molecular networking analysis enhanced with nonparametric statistics highlighted the upregulation of a molecular cluster (Kruskal–Wallis p = 1.6 e –6 for 1 ) in which no MS/MS features had library matches. Targeted isolation of these features resulted in the discovery of nine new N- acylated lipopeptides, albubactins A–H ( 1 – 8 ) each containing a unique glutamine tripeptide and a C -terminal ethyl ester moiety. Three related albubactin acids A–C ( 9 – 11 ) lacking the ethyl ester were also identified. NMR spectroscopy and UPLC-HR-ESI-MS/MS demonstrated that the albubactins were obtained as mixtures that shared a common m / z and differed only in their acylated terminal groups. Due to the complex spectroscopic elucidation with many overlapping shifts, a total synthesis of albubactin A ( 1 ) was completed and used to determine the absolute configuration of the new albubactins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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