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Enregistrement W4401420229 · doi:10.1016/j.cell.2024.05.059

Guidelines for minimal information on cellular senescence experimentation in vivo

2024· review· en· W4401420229 sur OpenAlexafffund
Mikołaj Ogrodnik, Juan Carlos Acosta, Peter D. Adams, Fabrizio d’Adda di Fagagna, Darren J. Baker, Cleo L. Bishop, Tamir Chandra, Manuel Collado, Jesús Gil, Vassilis G. Gorgoulis, Флориан Грубер, Eiji Hara, Pidder Jansen‐Dürr, Diana Jurk, Sundeep Khosla, James L. Kirkland, Valery Krizhanovsky, Tohru Minamino, Laura J. Niedernhofer, João F. Passos, Nadja Ring, Heinz Redl, Paul D. Robbins, Françis Rodier, Karin Scharffetter‐­Kochanek, John M. Sedivy, Ewa Sikora, Kenneth W. Witwer, Thomas von Zglinicki, Maximina H. Yun, Johannes Grillari, Marco Demaria

Notice bibliographique

RevueCell · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingAgencia Estatal de InvestigaciónFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institutes of HealthEuropean CommissionUniversität für Bodenkultur WienBuck Institute for Research on AgingHerzfelder'sche FamilienstiftungGeneral Secretariat for Research and TechnologyNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekMedical Research CouncilRegione LombardiaHorizon 2020 Framework ProgrammeFondation pour la Recherche MédicaleGlenn Foundation for Medical ResearchAustrian Science FundFondazione Regionale per la Ricerca BiomedicaZonMwAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroCancer Research SocietyImperial College LondonBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCancer Research UKNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerNoaber FoundationNational Cancer InstituteLudwig Boltzmann GesellschaftOvarian Cancer CanadaEuropean Regional Development FundMerck KGaAZentrum für Regenerative Therapien DresdenAllgemeine UnfallversicherungsanstaltBrown UniversityDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologySenescenceIn vivoCell biologyCellular senescenceComputational biologyGeneticsPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular senescence is a cell fate triggered in response to stress and is characterized by stable cell-cycle arrest and a hypersecretory state. It has diverse biological roles, ranging from tissue repair to chronic disease. The development of new tools to study senescence in vivo has paved the way for uncovering its physiological and pathological roles and testing senescent cells as a therapeutic target. However, the lack of specific and broadly applicable markers makes it difficult to identify and characterize senescent cells in tissues and living organisms. To address this, we provide practical guidelines called "minimum information for cellular senescence experimentation in vivo" (MICSE). It presents an overview of senescence markers in rodent tissues, transgenic models, non-mammalian systems, human tissues, and tumors and their use in the identification and specification of senescent cells. These guidelines provide a uniform, state-of-the-art, and accessible toolset to improve our understanding of cellular senescence in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,991
Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0050,003
Intégrité de la recherche0,0060,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0270,021

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations291
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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