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Enregistrement W4401868077 · doi:10.1021/jacs.4c02354

RNA-Activated CRISPR/Cas12a Nanorobots Operating in Living Cells

2024· article· en· W4401868077 sur OpenAlexaff
Aijiao Yuan, Rui Sha, Wenjing Xie, Guangbo Qu, Hongquan Zhang, Hailin Wang, X. Chris Le, Guibin Jiang, Hanyong Peng

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTrans-activating crRNACRISPRRNAChemistryNanoroboticsCleavage (geology)RibonucleoproteinCas9Guide RNANucleic acidComputational biologyCell biologyGeneBiologyBiochemistryNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Active clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR/Cas12a) systems possess both cis -cleavage (targeted) and trans -cleavage (collateral) activities, which are useful for genome engineering and diagnostic applications. Both single- and double-stranded DNA can activate crRNA–Cas12a ribonucleoprotein (RNP) to achieve cis - and trans -cleavage enzymatic activities. However, it is not clear whether RNA can activate the CRISPR/Cas12a system and what is critical to the trans -cleavage activity. We report here that RNA can activate the CRISPR/Cas12a system and trigger its trans -cleavage activity. We reveal that the activated crRNA–Cas12a RNP favors the trans -cleavage of longer sequences than commonly used. These new findings of the RNA-activated trans -cleavage capability of Cas12a provided the foundation for the design and construction of CRISPR nanorobots that operate in living cells. We assembled the crRNA–Cas12a RNP and nucleic acid substrates on gold nanoparticles to form CRISPR nanorobots, which dramatically increased the local effective concentration of the substrate in relation to the RNP and the trans -cleavage kinetics. Binding of the target microRNA to the crRNA–Cas12a RNP activated the nanorobots and their trans -cleavage function. The repeated (multiple-turnover) trans -cleavage of the fluorophore-labeled substrates generated amplified fluorescence signals. Sensitive and real-time imaging of specific microRNA in live cells demonstrated the promising potential of the CRISPR nanorobot system for future applications in monitoring and modulating biological functions within living cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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