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Enregistrement W4404029243 · doi:10.1101/2024.11.04.621834

F2,6BP restores mitochondrial genome integrity in Huntington’s Disease

2024· preprint· en· W4404029243 sur OpenAlexafffund
Anirban Chakraborty, Santi M. Mandal, Mikita Mankevich, Sravan Gopalkrishnashetty Sreenivasmurthy, Balaji Krishnan, Muralidhar L. Hegde, Gourisankar Ghosh, Tapas K. Hazra

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of AlbertaAlzheimer's Association
Mots-clésMitochondrial DNADiseaseBusinessGenomeMitochondrionNatural resource economicsBiologyCell biologyMedicineGeneticsEconomicsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Several reports have indicated that impaired mitochondrial function contributes to the development and progression of Huntington’s disease (HD). Mitochondrial genome damage, particularly DNA strand breaks, is a potential cause for its compromised functionality. Here we show that the activity of polynucleotide kinase 3’-phosphatase (PNKP), a critical DNA end-processing enzyme, is significantly decreased in the mitochondrial extract of HD patients’ brains due to a lower level of fructose-2,6 bisphosphate (F2,6BP), a biosynthetic product of 6-phosphofructo-2-kinase fructose-2,6-bisphosphatase 3 (PFKFB3). Such decrease in PNKP activity leads to persistent DNA strand breaks that are refractory to subsequent steps for repair completion. Both PFKFB3 and F2,6BP, an allosteric modulator of glycolysis, are also present in the mitochondria and PFKFB3 is part of a mitochondrial DNA repair complex containing HTT, PNKP, DNA Pol γ (POLG) and Lig IIIα. Notably, PNKP binds F2,6BP (Kd= 525±25 nM) and utilizes it as a cofactor. The levels of both F2,6BP and PFKFB3 are significantly decreased in the mitochondrial extract of HD mouse striatal neuronal cells and patients’ brain. Activity of PNKP is thus severely decreased in the mitochondrial extract; however, addition of F2,6BP restored its activity. Moreover, supplementation of F2,6BP in HD cells restored PFKFB3 level, mitochondrial genome integrity and partially restored mitochondrial membrane potential, mitochondrial respiration and prevented pathogenic aggregate formation. We also observed that supplementation with F2,6BP restored mitochondrial genome integrity in an HD Drosophila model. Our findings, therefore, suggest that F2,6BP-mediated restoration of PNKP activity could have a profound impact in ameliorating neurodegenerative symptoms in HD. Significance We reported earlier the loss of PNKP activity in the nuclear extracts from HD patients’ brain. However, a glycolytic metabolite, F2,6BP, can restore PNKP activity and rescue organismal phenotypes in HD fly models. As PNKP is present in mitochondria and several reports indicate that mitochondrial dysfunction contributes to HD, we therefore analyzed PNKP activity in the mitochondrial extract. Surprisingly, we found that PFKFB3 and its product, F2,6BP are present in mitochondria, but significantly low in patients’ brains. Exogenous addition of F2,6BP restored PNKP activity in patients’ brain mitochondrial extract. Moreover, supplementing F2,6BP in HD cells and fruit flies restored mitochondrial genome integrity suggesting maintaining adequate intracellular F2,6BP levels is critical for proper functionality of PNKP and thereby of brain health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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