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Enregistrement W4405049724 · doi:10.1016/s2468-1253(24)00311-x

International consensus statement on microbiome testing in clinical practice

2024· review· en· W4405049724 sur OpenAlexaff
Serena Porcari, Benjamin H. Mullish, Francesco Asnicar, Siew C. Ng, Liping Zhao, Richard Hansen, Paul W. O’Toole, Jeroen Raes, Georgina L. Hold, Lorenza Putignani, Christian Lodberg Hvas, Georg Zeller, Omry Koren, Hein M. Tun, Mireia Valles‐Colomer, María Carmen Collado, Monika Fischer, Jessica R. Allegretti, Tariq Iqbal, Benoit Chassaing, Josbert J. Keller, Simon Mark Dahl Baunwall, María T. Abreu, Giovanni Barbara, Faming Zhang, Francesca Romana Ponziani, Samuel P. Costello, Sudarshan Paramsothy, Dina Kao, Colleen Kelly, Juozas Kupčinskas, Ilan Youngster, Francesco Franceschi, Sahil Khanna, Maria J. G. T. Vehreschild, Alexander Link, Flavio De Maio, Edoardo Pasolli, Aitor Blanco‐Míguez, Patrizia Brigidi, Brunella Posteraro, Franco Scaldaferri, Françis Mégraud, Peter Malfertheiner, Luca Masucci, Manimozhiyan Arumugam, Nadeem O. Kaakoush, Eran Segal, Jasmohan S. Bajaj, Rupert W. Leong, John F. Cryan, Rinse K. Weersma, Rob Knight, Francisco Guarner, Fergus Shanahan, Patrice D. Cani, Eran Elinav, Maurizio Sanguinetti, Willem M. de Vos, Emad El‐Omar, Joël Doré, Julian R. Marchesi, Herbert Tilg, Harry Sokol, Nicola Segata, Giovanni Cammarota, Antonio Gasbarrini, Gianluca Ianiro

Notice bibliographique

Revue˜The œLancet. Gastroenterology & hepatology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMinistero dell'Istruzione e del MeritoH2020 European Research CouncilAgencia Estatal de InvestigaciónMedical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthGrifolsNational Heart, Lung, and Blood InstituteFondazione RomaIpsenAboca S.p.A. Società AgricolaCelltrionEisaiAstellas PharmaEli Lilly and CompanyAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroGastroenterological Society of AustraliaChinese University of Hong KongJanssen PharmaceuticalsMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaNovo NordiskDr. Falk PharmaNational Institute for Health and Care ResearchImperial College Healthcare NHS TrustImperial College LondonDanoneTillotts PharmaFonds De La Recherche Scientifique - FNRSEuropean Research CouncilMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesCelgeneNational Cancer InstituteHORIZON EUROPE Framework ProgrammeServierGilead SciencesAmgenNational Health and Medical Research CouncilWalloon excellence in life sciences and biotechnologySeres TherapeuticsSanofiMinistero della SalutePfizer
Mots-clésMicrobiomeMultidisciplinary approachHuman microbiomeMedicineClinical PracticeHealth careRisk analysis (engineering)Engineering ethicsIntensive care medicineBioinformaticsEngineeringNursingPolitical scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,033
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,048
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0330,048
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0050,006
Intégrité de la recherche0,0120,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,424
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations73
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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