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Enregistrement W4405852028 · doi:10.5376/gab.2024.15.0022

Comprehensive Genomic Identification and Characterization of R2R3-MYB Genes in Colored Rice (<i>Oryza sativa</i> L.): A Phylogenetic and Expression Analysis

2024· article· en· W4405852028 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenomics and Applied Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOryza sativaBiologyGenePhylogenetic treeIdentification (biology)GeneticsMYBRed riceBotanyGene expressionHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This review provides a comprehensive identification and characterization of the R2R3-MYB  gene family in colored rice ( Oryza sativa  L.), offering significant insights into their evolutionary relationships, structural features, and expression profiles. Notable findings include the distinctive structural characteristics of R2R3-MYB genes, such as the high prevalence of non-synonymous substitutions in the DNA-binding domains, particularly in the α-helix regions. This suggests adaptive selection and functional diversification. The phylogenetic analysis revealed the existence of distinct clades that correspond to different evolutionary lineages. Of particular interest is a key clade that is closely related to the ancestral species, wild rice ( O .  rufipogon  and O .  nivara ), which indicates the conservation of evolutionary lineages. The expression patterns of R2R3-MYB  genes were found to be specific to different tissues and developmentally regulated, with specialized roles in photosynthesis-related processes and root development. Furthermore, the study underscores the functional roles of R2R3-MYB  genes in anthocyanin biosynthesis. Genes such as OsC1  and OsKala3  play pivotal roles in modulating the expression of anthocyanin biosynthetic pathway genes, thereby contributing to the distinctive purple pigmentation and associated health benefits of purple rice. Furthermore, the case study of OsMYB30  and OsMYB60  illustrates their pivotal roles in plant defense mechanisms and leaf morphology, respectively. The insights gained from this review have significant implications for the breeding and genetic engineering of colored rice, emphasizing the potential for improving agronomic traits and enhancing crop performance through targeted manipulation of R2R3-MYB  genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,240
Score d'incertitude au seuil0,667

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle