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Enregistrement W4405999050 · doi:10.1101/2024.12.18.628357

A Locus Control Region Generates Distinct Active Placental Lactogen And Inactive Growth Hormone Gene Domains In Term Placenta That Are Disrupted With Obesity

2024· preprint· en· W4405999050 sur OpenAlexaff
Yan Jin, Ian McNicol, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlacental lactogenPlacentaEndocrinologyLocus (genetics)Internal medicineBiologyHormoneGeneGrowth hormoneGeneticsMedicinePregnancyFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A Placental villi include an outer layer of syncytiotrophoblasts (STBs) and an inner layer of cytotrophoblasts (CTBs) that fuse to generate STBs in pregnancy. While activation of the single locus containing the human (h) placental lactogen (hPL) genes ( hPL-A / CSH1 and hPL-B / CSH2 ) begins in the CTBs, their expression in STBs requires further epigenetic modifications as well as interactions between locus control region (LCR) and gene regulatory sequences. No transcription factor that limits or facilitates hPL LCR/gene interactions for locus activation is reported but the paternally-expressed gene 3 (PEG3/PW1) transcription factor is a candidate. PEG3 is expressed by villous CTBs but not STBs, and putative PEG3 sites were identified in the hPL LCR and promoter sequences. Furthermore, dysregulation of both hPL and PEG3 gene expression have been linked to peripartum depression. Using CTB-like JEG-3 cells, we show PEG3 binding to hypersensitive sites (HS III-V) within the LCR, and that hPL transcript levels increase with PEG-3 knockdown. In term placenta, PEG3 binding at placenta-specific HS IV was increased with maternal obesity, where a decrease in hPL RNA levels is seen, while PEG3 binding was reduced in women with obesity who develop insulin-treated gestational diabetes mellitus (O/GDM+Ins), where increased hPL gene expression is observed. Chromatin conformation capture revealed distinct hPL gene domain interactions that are modified with maternal obesity but largely reversed in O/GDM+Ins, correlating with PEG3 binding. Thus, decreased PEG3 binding may be required for hPL domain generation and expression during CTB to STB transition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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