lncRNA <i>CARINH</i> regulates expression and function of innate immune transcription factor IRF1 in macrophages
Notice bibliographique
Résumé
The discovery of long non-coding RNAs (lncRNAs) has provided a new perspective on the centrality of RNA in gene regulation and genome organization. Here, we screened for lncRNAs with putative functions in the host response to single-stranded RNA respiratory viruses. We identify CARINH as a conserved cis-acting lncRNA up-regulated in three respiratory diseases to control the expression of its antisense gene IRF1 , a key transcriptional regulator of the antiviral response. CARINH and IRF1 are coordinately increased in the circulation of patients infected with human metapneumovirus, influenza A virus, or SARS-CoV-2, and in macrophages in response to viral infection or TLR3 agonist treatment. Targeted depletion of CARINH or its mouse ortholog Carinh in macrophages reduces the expression of IRF1/Irf1 and their associated target gene networks, increasing susceptibility to viral infection. Accordingly, CRISPR-mediated deletion of Carinh in mice reduces antiviral immunity, increasing viral burden upon sublethal challenge with influenza A virus. Together, these findings identify a conserved role of lncRNA CARINH in coordinating interferon-stimulated genes and antiviral immune responses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».