Identification of neurodevelopmental organization of the cell populations of juvenile Huntington’s disease using dorso-ventral HD organoids and HD mouse embryos
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Huntington’s disease (HD) is a polyglutamine neurodegenerative disease involving pathogenesis within the striatum and cerebral cortex and a neurodevelopmental component, particularly in juvenile HD form (JOHD). We established a fused HD dorsal-ventral system, imitating the cortex and striatum interaction in a single organoid to discover neurodevelopmental impairments at the level of cell populations. We found a range of early pathogenic phenotypes indicating that brain development in HD is affected by impaired neurogenesis. The phenotypes occurred already in early-stage 60-day organoids and the brain of humanized mouse embryos, at time of the beginning of the neurogenesis and choroid plexus development. We demonstrated that HD organoids and HD mouse embryonic brains had gene expression profiles of impaired maturation of neurons and increased expression of genes responsible for proliferation compared to genes responsible for differentiation in control organoids. By using scRNA-seq, the choroid plexus population was highly abundant in HD organoids and embryonic brains. Cortical and choroid plexus cell populations in HD organoids and brains co-expressed genes responsible for HTT function (mitotic spindle and cilia). The impaired maturation and the increased occurrence of the choroid plexus populations were mitigated in our compensatory model, mosaic dorsal/ventral (D/V) or V/D HD/control organoids. Finally, we found that TTR protein, a choroid plexus marker, is elevated in the adult HD mouse serum, indicating that TTR may be a promising marker for detecting HD. In summary, the fused dorso-ventral HD organoids identify a spectrum of neurodevelopmental features, including increased proliferation and delayed cell maturation. We demonstrate that the choroid plexus population is characteristic of aberrant HD neurodevelopment, and contains TTR marker, which can be translated as a blood marker in HD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».