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Enregistrement W4407315970 · doi:10.1371/journal.pone.0305511

PCK1 and SLC22A2 gene variants associated with response to metformin treatment in type 2 diabetes

2025· article· en· W4407315970 sur OpenAlexafffund
Sophie St-Amour, Laurence Tessier, Janie Harnois, Catherine Allard, Alexandre Lavoie, Philippe Caron, Luigi Bouchard, Patrice Perron, Karine Tremblay

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes Treatment and Management
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFaculté de médecine et des sciences de la santé, Université de SherbrookeCanadian Institutes of Health ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéDiabète Québec
Mots-clésMetforminPharmacogeneticsType 2 diabetesMedicineOdds ratioGenotypingLinkage disequilibriumCandidate geneInternal medicineConfidence intervalAlleleDiabetes mellitusGenotypeBioinformaticsGeneticsGeneBiologyHaplotypeEndocrinologyInsulin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type 2 diabetes (T2D) is a chronic disorder affecting 462 million worldwide, often managed with metformin as first-line treatment. However, metformin's response varies among individuals, including up to 30% experiencing serious adverse drug reactions (ADRs) and 20-50% inefficacy. These differences may be due to various factors, including pharmacogenetic (PGx) variants. The PGx variants documented so far could affect both the safety and efficacy of metformin, but due to a lack of replication studies, none reached the clinical evidence-level needed to be used as a predictive marker for treatment response. Therefore, this study aims to evaluate the association between the presence of candidate PGx variants and metformin response in T2D subjects. We conducted an association study involving 108 T2D participants currently or previously treated with metformin. A characterization of their therapeutic response was carried out through questionnaires and pharmacological profile reviews. DNA samples were collected during their single visit to perform genotyping of 24 selected candidate PGx variants. Association analyses between candidate PGx variants and metformin response were performed. Among the subjects included in the analyses (n = 84), 25% were non-responders, and 58% experienced ADRs. At the time of study enrollment, 93.9% of non-responders continued to use metformin. The odds of being a non-responder to metformin are 5.6 times higher for homozygous carriers of the alternative allele of a variant within the PCK1 gene (rs4810083) compared to the other genotypes (95% interval confidence [1.9-16.6]). Two variants in perfect linkage disequilibrium within the SLC22A2 gene (rs316019 and rs316009) were associated with increase odds of having ADRs, where homozygous genotype carriers are 7.3 times more likely to have ADRs presentation (95% interval confidence [1.85-29.01]). This study identified associations between PCK1 and SLC22A2 candidate PGx variants and metformin response in T2D treatment. Additional genetic and functional studies are necessary to elucidate the variants' impact in metformin's pharmacological mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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