Differential gene expression mediates physiological responses to perceived predation risk in a developmentally plastic vertebrate, the northern leopard frog (Lithobates pipiens)
Notice bibliographique
Résumé
Prey can respond to predation risk through developmental plasticity, generating anti-predator phenotypes. These inducible defenses arise from changes to the stress axis, and neuroendocrine-triggered gene regulation is a likely mechanism influencing such phenotypes. As tadpoles, amphibians improve their escape performance by modifying tail shape in response to perceived predation risk (PPR), and this process should involve tissue and developmentally specific gene regulation. We exposed Lithobates pipiens tadpoles to PPR from Aeshnidae predators and measured tail morphology and transcriptomic response across different tissues (head and tail) and development (pre-metamorphosis to pro-metamorphosis). We found that PPR induced plasticity in tail shape, and this response was suppressed when tadpoles were also exposed to a glucocorticoid synthesis inhibitor. Differential gene expression was associated with predation stress across head and tail tissue, and developmental stage. Predator-exposed tadpoles exhibited up-regulation of genes responsible for muscle tissue and nervous system development, primarily in tail tissue and in pre-metamorphosis. PPR broadly influenced pathways across tissues and metamorphosis, including developmental, endocrine, and immune system pathways. This study provides an important step in understanding transcriptomic responses during predator induced morphological change, and demonstrates that gene expression, as induced by perceived predation risk, is a prominent mechanism of developmental plasticity.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».