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Enregistrement W4411299228 · doi:10.1099/jgv.0.002077

Annual (2024) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota)

2025· article· en· W4411299228 sur OpenAlexaff
Jens H. Kuhn, Scott Adkins, Sergey V. Alkhovsky Альховский Сергей Владимирович, Wenxia An 安雯霞, Tatjana Avšič‐Županc, Marı́a A. Ayllón, Katarina Bačnik, Justin Bahl, Anne Balkema‐Buschmann, Matthew J. Ballinger, Martin Beer, Nicolás Bejerman, Éric Bergeron, Nadine Biedenkopf, Carol D. Blair, Kim R. Blasdell, Steven B. Bradfute, Thomas Briese, Katherine A. Brown, Ursula J. Buchholz, Michael J. Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity J. Burt, Charles H. Calisher, Sten Calvelage, Mengji Cao, Inmaculada Casas, Kartik Chandran, Rémi N. Charrel, Anya Crane, Laura N. Cuypers, Elena Dal Bó, Juan Carlos de la Torre, William Marciel de Souza, Rik L. de Swart, Humberto Debat, Nolwenn M. Dheilly, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G. Dietzgen, M. Digiaro, Jan Felix Drexler, W. Paul Duprex, Ralf Dürrwald, Andrew J. Easton, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Mirette I. Y. Eshak, Guozhong Feng 冯国忠, Andrew E. Firth, Anthony R. Fooks, Pierre Formenty, Juliana Freitas‐Astúa, Conrad M. Freuling, Tuija Gadd, Selma Gago‐Zachert, María Laura García, Adolfo García‐Sastre, Aura R. Garrison, Tony L. Goldberg, Jean‐Paul Gonzalez, Joë̈lle Goü̈y de Bellocq, Anthony Griffiths, Martin H. Groschup, Sophie Gryseels, Ion Gutiérrez‐Aguirre, Stephan Günther, John Hammond, Jussi Hepojoki, Masayuki Horie, Adam J. Hume, Timothy H. Hyndman, Dirk W. Höper, Dàohóng Jiāng, Sandra Junglen, Boris Klempa, Jonas Klingström, Hideki Kondō, Eugene V. Koonin, Mart Krupovìč, Kenji Kubota, Gael Kurath, Denis Kutnjak, Lies Laenen, Amy J. Lambert, Benhur Lee, Chengyu Li 李呈宇, Jiànróng Lǐ, Jun‐Min Li, Igor S. Lukashevich, Piet Maes, Marco Marklewitz, Sergio H. Marshall, Shin-Yi Lee Marzano, John W. McCauley, Nataša Mehle, Alì Mirazimi, Toshiyuki Morikawa 守川俊幸, Elke Mühlberger, T. Müller, R. A. Naidu, Tomohide Natsuaki, Beatriz Navarro, Yutaro Neriya, Netesov Sv, Vittorio Nicoloso, Gabriele Neumann, Tiina Nokireki, Norbert Nowotny, Márcio Roberto Teixeira Nunes, Francisco M. Ochoa‐Corona, Gustavo Palacios, Vicente Pallás, Anna Papa, Sofia Paraskevopoulou, Colin R. Parrish, Alex Pauvolid‐Corrêa, Anja Pecman, Daniel R. Pérez, Florian Pfaff, Richard K. Plemper, Thomas S. Postler, Sheli R. Radoshitzky, Pedro Luis Ramos‐González, Maja Ravnikar, Renato O. Resende, Gábor Reuter, Carina A. Reyes, Mark Paul Selda Rivarez, Vı́ctor Romanowski, Dennis Rubbenstroth, Luisa Rubino, Jonathan A. Runstadler, Ana Ruiz-Padilla, Sead Sabanadzovic, María S. Salvato, Takahide Sasaya, Connie S. Schmaljohn, Heike Schmidt‐Posthaus, Martin Schwemmle, Gabrijel Seljak, Torsten Seuberlich, Mǎng Shī, Yoshifumi Shimomoto, Peter Simmonds, Manuela Sironi, Donald B. Smith, Sophie J. Smither, Jin‐Won Song, Kirsten Spann, Jessica R. Spengler, Mark D. Stenglein, Ayato Takada, Chika Takemura, Niina Tammiranta, Robert B. Tesh, Natalie J. Thornburg, Nicole D. Tischler, Yasuhiro Tomitaka, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Massimo Turina, Ioannis E. Tzanetakis, Bernadette van den Hoogen, Bert Vanmechelen, Nikos Vasilakis, M. Verbeek, Susanne von Bargen, Ana Vučurović, Jiro Wada, Victoria Wahl‐Jensen, Peter J. Walker, Fei Wang, Anna E. Whitfield, John V. Williams, Yuri I. Wolf, Hironobu Yanagisawa, Caixia Yang 杨彩霞, Gōngyín Yè, Meng Yu, F. Murilo Zerbini, Arnfinn Lodden Økland, Holly R. Hughes

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesScience and Technology DirectorateBattelleAgricultural Research ServiceU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthNational Institute of Food and AgricultureMaine Agricultural and Forest Experiment StationU.S. Department of DefenseWorld Health OrganizationU.S. Department of Homeland SecurityAgencia Nacional de Investigación y DesarrolloU.S. Department of Agriculture
Mots-clésPhylumBiologyTaxonomy (biology)RNATaxonVirus classificationEvolutionary biologyRNA polymerasePhylogeneticsGeneticsVirologyZoologyGenomeGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In April 2024, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was expanded by 1 new order, 1 new family, 6 new subfamilies, 34 new genera and 270 new species. One class, two orders and six species were renamed. Seven families and 12 genera were moved; ten species were renamed and moved; and nine species were abolished. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as currently accepted by the ICTV, providing an essential annual update on the classification of members of this phylum that deepen understandings of their evolution, and supports critical public health measures for virus identification and tracking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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