Zyxin directly binds to chromosomal DNA and is linked with mitochondrial integrity and apoptosis
Notice bibliographique
Résumé
Human zyxin is a key component of the focal adhesion complex, playing a role in mediating cell-cell adhesion and cytoskeletal dynamics. Moreover, zyxin shuttles between the cytoplasm and the nucleus, where it contributes to regulating gene expression. Although identified over 30 years ago, zyxin's nuclear functions, particularly in relation to cancer, remain largely unexplored. In this study, we profiled zyxin binding to chromosomal DNA using metastatic prostate carcinoma PC3M cells as a model. Our ChIP-Seq results revealed that zyxin binds to chromosomal DNA, with mitochondrial pseudogenes as the primary targets. Furthermore, we demonstrated that the LIM domains of zyxin are sufficient for DNA binding and that zyxin knockdown leads to transcriptional changes in mitochondrial pseudogenes. Additionally, zyxin knockdown impacted several other genes associated with mitochondrial integrity and apoptosis, resulting in disturbances in MTCO2P2 RNA localization, mitochondrial membrane potential, increased reactive oxygen species, alterations in the cell cycle, and progression towards apoptosis. Overall, our work shows that zyxin directly interacts with nuclear DNA and regulates the transcription of mitochondrial pseudogenes, emphasizing its role in modulating mitochondrial function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».